RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 PFKFB2O60825 505 aa18.2■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC175P0C221 793 aa18.2■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 CTDSPL2Q05D32 466 aa18.2■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 POLA2Q14181 598 aa18.2■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 MYL10Q9BUA6 226 aa18.2■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 CBX8Q9HC52 389 aa18.2■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 ASAP1Q9ULH1 1129 aa18.2■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF202O95125 648 aa18.2■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 PDE8BO95263 885 aa18.2■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 QRICH2Q9H0J4 1663 aa18.19■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 FGAP02671 866 aa18.19■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 DNA2P51530 1060 aa18.19■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 PYCARDQ9ULZ3 195 aa18.19■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa18.19■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 DESP17661 470 aa18.19■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 SSR1P43307 286 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 MYSM1Q5VVJ2 828 aa18.19■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 ATG3Q9NT62 314 aa18.19■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 CEP152O94986 1710 aa18.18■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 PLCD1P51178 756 aa18.18■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 UBE3CQ15386 1083 aa18.18■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 JADE2Q9NQC1 790 aa18.18■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 LIG1P18858 919 aa18.18■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 NOP2P46087 812 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 ADCK5Q3MIX3 580 aa18.18■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 TAF3Q5VWG9 929 aa18.18■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa18.17■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 SIK1P57059 783 aa18.17■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa18.17■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 NBPF14Q5TI25 921 aa18.17■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 WDR78Q5VTH9 848 aa18.17■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 KRT222Q8N1A0 295 aa18.17■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa18.17■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 KIAA0754O94854 1291 aa18.17■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 SLU7O95391 586 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 NEFHP12036 1026 aa18.17■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 LETM2Q2VYF4 491 aa18.17■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 IFNL3Q8IZI9 196 aa18.17■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 GREM2Q9H772 168 aa18.17■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 PPP1R2P41236 205 aa18.17■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 MLKLQ8NB16 471 aa18.17■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC172P0C7W6 258 aa18.16■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 LRMPQ12912 555 aa18.16■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 LRRC7Q96NW7 1537 aa18.16■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 HEG1Q9ULI3 1381 aa18.16■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 TMCO5BA8MYB1 307 aa18.16■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF75DP51815 510 aa18.16■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 MMRN2Q9H8L6 949 aa18.16■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 WWC3Q9ULE0 1092 aa18.16■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa18.16■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 TULP4Q9NRJ4 1543 aa18.16■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 TTC38Q5R3I4 469 aa18.16■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 ADALQ6DHV7 355 aa18.16■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa18.16■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 MAST3O60307 1309 aa18.16■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 NCAPD2Q15021 1401 aa18.16■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 OGFRQ9NZT2 677 aa18.16■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 USP8P40818 1118 aa18.15■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 KRT83P78385 493 aa18.15■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 PPARAQ07869 468 aa18.15■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF654Q8IZM8 581 aa18.15■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa18.15■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa18.15■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 CYP21A2P08686 494 aa18.15■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 CNGA4Q8IV77 575 aa18.15■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC24Q8N4L8 307 aa18.15■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 USP31Q70CQ4 1352 aa18.15■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 USP17L12C9JPN9 530 aa18.14■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 USP17L21D6R901 530 aa18.14■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 SASH1O94885 1247 aa18.14■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 USP28Q96RU2 1077 aa18.14■□□□□ 0.5
C9orf172-201ENST00000436881 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
C9orf172-201ENST00000436881 MTX1Q13505 466 aa18.14■□□□□ 0.49
C9orf172-201ENST00000436881 UBXN1Q04323 297 aa18.14■□□□□ 0.49
C9orf172-201ENST00000436881 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
C9orf172-201ENST00000436881 FERMT2Q96AC1 680 aa18.14■□□□□ 0.49
C9orf172-201ENST00000436881 ADCY9O60503 1353 aa18.14■□□□□ 0.49
C9orf172-201ENST00000436881 CTAGE15A4D2H0 777 aa18.14■□□□□ 0.49
C9orf172-201ENST00000436881 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
C9orf172-201ENST00000436881 KRT86O43790 486 aa18.14■□□□□ 0.49
C9orf172-201ENST00000436881 CTAGE8P0CG41 777 aa18.14■□□□□ 0.49
C9orf172-201ENST00000436881 ADD1P35611 737 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
C9orf172-201ENST00000436881 CTAGE6Q86UF2 777 aa18.14■□□□□ 0.49
C9orf172-201ENST00000436881 CTAGE4Q8IX94 777 aa18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms