RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

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Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 SOX18P35713 384 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 PI16Q6UXB8 463 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 PMEPA1Q969W9 287 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM161BQ96MY7 647 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPHS2Q9NP85 383 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 TONSLQ96HA7 1378 aa6.3□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 COL18A1P39060 1754 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIN3BO75182 1162 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT76Q01546 638 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLAURQ03405 335 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBF1Q8TES7 1133 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGFLR1Q9H665 355 aa6.29□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUP188Q5SRE5 1749 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIF4AO95239 1232 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARAFP10398 606 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 NRLP54845 237 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 DAB2P98082 770 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 FGD1P98174 961 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 IRF7Q92985 503 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFRSF25Q93038 417 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 STK17AQ9UEE5 414 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 RREB1Q92766 1687 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLIT3O75094 1523 aa6.28□□□□□ -1.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.27□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 J3QW42 95 aa6.27□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACPPP15309 386 aa6.27□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNA15P30679 374 aa6.27□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAP2K3P46734 347 aa6.27□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPLD1P80108 840 aa6.27□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.27□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.27□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMC4Q7Z404 712 aa6.27□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.27□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.27□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDK19Q9BWU1 502 aa6.27□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.27□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA0232Q92628 1395 aa6.27□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.27□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACEP12821 1306 aa6.26□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP6P35125 1406 aa6.26□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 NFAT5O94916 1531 aa6.26□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.26□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PP55 124 aa6.26□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 E9PSI1 815 aa6.26□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADH6P28332 368 aa6.26□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIK1P57059 783 aa6.26□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 HYAL2Q12891 473 aa6.26□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.26□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEP120Q8N960 986 aa6.26□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 MDFIQ99750 246 aa6.26□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.26□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.26□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 GGA1Q9UJY5 639 aa6.26□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa6.26□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.25□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.25□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRPA1O75762 1119 aa6.25□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 EDN3P14138 238 aa6.25□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 GMPRP36959 345 aa6.25□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMD2Q13200 908 aa6.25□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHRNA2Q15822 529 aa6.25□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 NBPF8Q3BBV2 869 aa6.25□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.25□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.25□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAGPAQ9UK23 515 aa6.25□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPG7Q9UQ90 795 aa6.25□□□□□ -1.41
RPS3AP54-201ENST00000435535 AK5Q9Y6K8 562 aa6.25□□□□□ -1.41
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