RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

BASIC

Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 CTAGE9A4FU28 777 aa24.93■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 RHOXF2BP0C7M4 288 aa24.93■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa24.93■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa24.93■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 TADA2BQ86TJ2 420 aa24.93■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 RHOXF2Q9BQY4 288 aa24.93■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.93■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF569Q5MCW4 686 aa24.93■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 WDR93Q6P2C0 686 aa24.93■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 MAP3K14Q99558 947 aa24.93■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.92■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 CTAGE15A4D2H0 777 aa24.92■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.92■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 CTAGE8P0CG41 777 aa24.92■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.92■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.92■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 CTAGE6Q86UF2 777 aa24.92■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 CTAGE4Q8IX94 777 aa24.92■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 TOMM22Q9NS69 142 aa24.92■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.92■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 MAN1B1Q9UKM7 699 aa24.92■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 MAST3O60307 1309 aa24.92■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 A0A1B0GTH6 734 aa24.91■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 PHACTR2O75167 634 aa24.91■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 PIP4K2BP78356 416 aa24.91■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.91■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 DACH1Q9UI36 760 aa24.91■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.91■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 A0A0U1RQJ8 604 aa24.91■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 PDIA6Q15084 440 aa24.91■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.91■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 MLKLQ8NB16 471 aa24.91■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 AFAP1L1Q8TED9 768 aa24.91■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 ATRIPQ8WXE1 791 aa24.91■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 KCNH3Q9ULD8 1083 aa24.91■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 GOLIM4O00461 696 aa24.9■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 CPLX1O14810 134 aa24.9■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 RNF40O75150 1001 aa24.9■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.9■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 NT5DC1Q5TFE4 455 aa24.9■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 MCTP2Q6DN12 878 aa24.9■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 FAM107BQ9H098 131 aa24.9■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 ANKRD65E5RJM6 399 aa24.9■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 CLIC6Q96NY7 704 aa24.9■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.89■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 VPS37DQ86XT2 251 aa24.89■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 SLC35F6Q8N357 371 aa24.89■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
CLDN5-201ENST00000403084 SYF2O95926 243 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 CEP89Q96ST8 783 aa24.89■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 FOXN1O15353 648 aa24.88■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 PRC1O43663 620 aa24.88■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 TBX22Q9Y458 520 aa24.88■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 SARSP49591 514 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 MORC3Q14149 939 aa24.87■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 MED15Q96RN5 788 aa24.87■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa24.87■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 SPEF2Q9C093 1822 aa24.87■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 FECHP22830 423 aa24.87■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 IP6K1Q92551 441 aa24.87■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 RBL2Q08999 1139 aa24.86■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC91Q7Z6B0 441 aa24.86■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 MYO1AQ9UBC5 1043 aa24.86■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.86■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 PBX1P40424 430 aa24.86■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 POSTNQ15063 836 aa24.86■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 PPFIBP1Q86W92 1011 aa24.86■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 TRIML1Q8N9V2 468 aa24.86■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 M0R2C6 588 aa24.85■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 GSCP56915 257 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 ECM29Q5VYK3 1845 aa24.85■■□□□ 1.57
CLDN5-201ENST00000403084 PXDNQ92626 1479 aa24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms