RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM106CQ9BVX2 250 aa16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-202ENST00000393503 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-202ENST00000393503 SRRDQ9UH36 339 aa16.52■□□□□ 0.24
CNGA3-202ENST00000393503 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 AK9Q5TCS8 1911 aa16.51■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 ENTPD3O75355 529 aa16.51■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 SCYL3Q8IZE3 742 aa16.51■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa16.51■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 PHIPQ8WWQ0 1821 aa16.51■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 FAM196BA6NMK8 535 aa16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 SRGAP3O43295 1099 aa16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 TRIM27P14373 513 aa16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 BTDP43251 543 aa16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 MECOMQ03112 1051 aa16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 NBPF11Q86T75 865 aa16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 HMG20BQ9P0W2 317 aa16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 ABCF2Q9UG63 623 aa16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 GABRQQ9UN88 632 aa16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 ZHX2Q9Y6X8 837 aa16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 PTPRFP10586 1907 aa16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa16.49■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa16.49■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 CXCL11O14625 94 aa16.49■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 BCAR3O75815 825 aa16.49■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 PRKCZQ05513 592 aa16.49■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 PICALMQ13492 652 aa16.49■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 KIF22Q14807 665 aa16.49■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 ARHGEF6Q15052 776 aa16.49■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa16.49■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 ARHGAP45Q92619 1136 aa16.49■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa16.48■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 GNRH1P01148 92 aa16.48■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP16.48■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 MYPNQ86TC9 1320 aa16.47■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 H0YGN5 161 aa16.47■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 DOCK1Q14185 1865 aa16.47■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 GRK4P32298 578 aa16.46■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 MCAMP43121 646 aa16.46■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 PRMT2P55345 433 aa16.46■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 TREML2Q5T2D2 321 aa16.46■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 GCC1Q96CN9 775 aa16.46■□□□□ 0.23
CNGA3-202ENST00000393503 TRIM75PA6NK02 468 aa16.45■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 GNAI3P08754 354 aa16.45■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 CCL5P13501 91 aa16.45■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 JAG1P78504 1218 aa16.45■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 GADL1Q6ZQY3 521 aa16.45■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 SPATA5Q8NB90 893 aa16.45■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 CLUAP1Q96AJ1 413 aa16.45■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 NEUROD6Q96NK8 337 aa16.45■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 PICK1Q9NRD5 415 aa16.45■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 MGAMO43451 1857 aa16.45■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 SIPA1L1O43166 1804 aa16.45■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 MVPQ14764 893 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 ERICH6Q7L0X2 663 aa16.44■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 RAET1EQ8TD07 263 aa16.44■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 UNC93B1Q9H1C4 597 aa16.44■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 AKAP2Q9Y2D5 859 aa16.44■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 CCER2I3L3R5 266 aa16.43■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 TBC1D12O60347 775 aa16.43■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 ELNP15502 786 aa16.43■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa16.43■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 ADGRA1Q86SQ6 560 aa16.43■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 GJB1P08034 283 aa16.42■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 GJA8P48165 433 aa16.42■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 FLT3LGP49771 235 aa16.42■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 FCGRTP55899 365 aa16.42■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 POLA2Q14181 598 aa16.42■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM57Q8N5G2 664 aa16.42■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 DNAJC18Q9H819 358 aa16.42■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 SNRKQ9NRH2 765 aa16.42■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 HDAC5Q9UQL6 1122 aa16.42■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa16.42■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 LAMA3Q16787 3333 aa16.42■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 DOCK3Q8IZD9 2030 aa16.41■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 PEX10O60683 326 aa16.41■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 GNAI2P04899 355 aa16.41■□□□□ 0.22
CNGA3-202ENST00000393503 HOXD10P28358 340 aa16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms