RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 TEX11Q8IYF3 940 aa18.17■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa18.17■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 WRNIP1Q96S55 665 aa18.17■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 BEGAINQ9BUH8 593 aa18.17■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 IGSF3O75054 1194 aa18.16■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 LBX1P52954 281 aa18.16■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 MAP3K12Q12852 859 aa18.16■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 DCAF15Q66K64 600 aa18.16■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 MIGA1Q8NAN2 632 aa18.16■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 HOOK2Q96ED9 719 aa18.16■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 HAUS7Q99871 368 aa18.16■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF341Q9BYN7 854 aa18.16■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa18.16■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa18.16■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 BAG3O95817 575 aa18.15■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 INPP5BP32019 993 aa18.15■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 ECHDC1Q9NTX5 307 aa18.15■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 PAG1Q9NWQ8 432 aa18.15■□□□□ 0.5
CSAG1-201ENST00000361211 NPM3O75607 178 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 PDE6AP16499 860 aa18.14■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 AAMPQ13685 434 aa18.14■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SLFNL1Q499Z3 407 aa18.14■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa18.14■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 OPTNQ96CV9 577 aa18.14■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 RNF186Q9NXI6 227 aa18.14■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF112Q9UJU3 913 aa18.14■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 CSADQ9Y600 493 aa18.14■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 FOCADQ5VW36 1801 aa18.14■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 LAMB1P07942 1786 aa18.13■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 CHGBP05060 677 aa18.13■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 PLCG2P16885 1265 aa18.13■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa18.13■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa18.13■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 FLT1P17948 1338 aa18.13■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF532Q9HCE3 1301 aa18.13■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SIPA1L1O43166 1804 aa18.12■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa18.12■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 FAM196BA6NMK8 535 aa18.12■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 CA12O43570 354 aa18.12■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 TRPA1O75762 1119 aa18.12■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 IGHDP01880 384 aa18.12■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 TM4SF4P48230 202 aa18.12■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SPDYE5A6NIY4 337 aa18.11■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 PHF20L1A8MW92 1017 aa18.11■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 MAP3K10Q02779 954 aa18.11■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SREBF2Q12772 1141 aa18.11■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD45Q5TZF3 282 aa18.11■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 GCC1Q96CN9 775 aa18.11■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 OTUD5Q96G74 571 aa18.11■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 GPATCH3Q96I76 525 aa18.11■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 PRDM10Q9NQV6 1147 aa18.11■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SAGE1Q9NXZ1 904 aa18.11■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SALL3Q9BXA9 1300 aa18.11■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 ADD2P35612 726 aa18.1■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 PI4K2BQ8TCG2 481 aa18.1■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa18.09■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP18.09■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa18.09■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 ERO1BQ86YB8 467 aa18.09■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 MS4A4AQ96JQ5 239 aa18.09■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 MYH7P12883 1935 aa18.08■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 TTC41PQ6P2S7 1318 aa18.08■□□□□ 0.49
CSAG1-201ENST00000361211 MX1P20591 662 aa18.08■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 IFNL1Q8IU54 200 aa18.08■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 SMC5Q8IY18 1101 aa18.08■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 LCORLQ8N3X6 602 aa18.08■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 PTPN18Q99952 460 aa18.08■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 PALD1Q9ULE6 856 aa18.08■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 IRF6O14896 467 aa18.07■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 TBC1D12O60347 775 aa18.07■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 TBC1D8O95759 1140 aa18.07■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 USP5P45974 858 aa18.07■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 CERS3Q8IU89 383 aa18.07■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 BRI3BPQ8WY22 251 aa18.07■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP18.07■□□□□ 0.48
CSAG1-201ENST00000361211 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms