RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361036.10

GPAA1-202, Transcript of glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GPAA1, Length 1,840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1-202ENST00000361036 KDM4AO75164 1064 aa24.35■■□□□ 1.49
GPAA1-202ENST00000361036 BAG3O95817 575 aa24.35■■□□□ 1.49
GPAA1-202ENST00000361036 FGRP09769 529 aa24.35■■□□□ 1.49
GPAA1-202ENST00000361036 CERS5Q8N5B7 392 aa24.35■■□□□ 1.49
GPAA1-202ENST00000361036 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
GPAA1-202ENST00000361036 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GPAA1-202ENST00000361036 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GPAA1-202ENST00000361036 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa24.35■■□□□ 1.49
GPAA1-202ENST00000361036 LAMB1P07942 1786 aa24.35■■□□□ 1.49
GPAA1-202ENST00000361036 DDX11L8A8MPP1 907 aa24.35■■□□□ 1.49
GPAA1-202ENST00000361036 SBK1Q52WX2 424 aa24.35■■□□□ 1.49
GPAA1-202ENST00000361036 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
GPAA1-202ENST00000361036 PODNQ7Z5L7 613 aa24.35■■□□□ 1.49
GPAA1-202ENST00000361036 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.35■■□□□ 1.49
GPAA1-202ENST00000361036 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
GPAA1-202ENST00000361036 GAKO14976 1311 aa24.34■■□□□ 1.49
GPAA1-202ENST00000361036 CTDNEP1O95476 244 aa24.34■■□□□ 1.49
GPAA1-202ENST00000361036 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.34■■□□□ 1.49
GPAA1-202ENST00000361036 JAK2O60674 1132 aa24.33■■□□□ 1.49
GPAA1-202ENST00000361036 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.33■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 CERS3Q8IU89 383 aa24.33■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 SLF2Q8IX21 1173 aa24.33■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 SCN9AQ15858 1988 aa24.32■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 G3V3G9 751 aa24.32■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 BTDP43251 543 aa24.32■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.32■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.32■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 MTA3Q9BTC8 594 aa24.32■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.32■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 LY9Q9HBG7 655 aa24.32■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 SENP2Q9HC62 589 aa24.32■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 MTMR6Q9Y217 621 aa24.32■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 LIFRP42702 1097 aa24.31■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 EVX2Q03828 476 aa24.31■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.31■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 KCNQ5Q9NR82 932 aa24.31■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.31■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 MXD3Q9BW11 206 aa24.31■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 CYP2D6P10635 497 aa24.3■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 PDCP20941 246 aa24.3■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 RHBDL3P58872 404 aa24.3■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.3■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.3■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 FBXW7Q969H0 707 aa24.3■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 TOMM22Q9NS69 142 aa24.3■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 USP17L8P0C7I0 530 aa24.29■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 USP5P45974 858 aa24.29■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.29■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 CCDC93Q567U6 631 aa24.29■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.29■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.29■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 MCM9Q9NXL9 1143 aa24.29■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa24.29■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 NAV1Q8NEY1 1877 aa24.29■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.28■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 ECE2O60344 883 aa24.28■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 PLCG2P16885 1265 aa24.28■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 C12orf60Q5U649 245 aa24.28■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa24.28■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 ESR2Q92731 530 aa24.28■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 ORC4O43929 436 aa24.28■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 F13A1P00488 732 aa24.28■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 AOC3Q16853 763 aa24.28■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 MCTP1Q6DN14 999 aa24.28■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 APOA5Q6Q788 366 aa24.28■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 TCHHQ07283 1943 aa24.27■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 FOCADQ5VW36 1801 aa24.27■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.27■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
GPAA1-202ENST00000361036 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.26■■□□□ 1.47
GPAA1-202ENST00000361036 GOLGA6L22H0YM25 854 aa24.26■■□□□ 1.47
GPAA1-202ENST00000361036 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
GPAA1-202ENST00000361036 DDX11Q96FC9 970 aa24.26■■□□□ 1.47
GPAA1-202ENST00000361036 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa24.26■■□□□ 1.47
GPAA1-202ENST00000361036 F8W031 263 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
GPAA1-202ENST00000361036 PTMSP20962 102 aa24.26■■□□□ 1.47
GPAA1-202ENST00000361036 DACT2Q5SW24 774 aa24.26■■□□□ 1.47
GPAA1-202ENST00000361036 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.26■■□□□ 1.47
GPAA1-202ENST00000361036 TEX11Q8IYF3 940 aa24.26■■□□□ 1.47
GPAA1-202ENST00000361036 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.26■■□□□ 1.47
GPAA1-202ENST00000361036 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
GPAA1-202ENST00000361036 TRAK2O60296 914 aa24.25■■□□□ 1.47
GPAA1-202ENST00000361036 PRDM1O75626 825 aa24.25■■□□□ 1.47
GPAA1-202ENST00000361036 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
GPAA1-202ENST00000361036 SEC23AQ15436 765 aa24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms