RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 ACRBPQ8NEB7 543 aa8.4□□□□□ -1.06
CCR6-202ENST00000349984 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CCR6-202ENST00000349984 TTLL11Q8NHH1 800 aa8.4□□□□□ -1.06
CCR6-202ENST00000349984 KLHDC4Q8TBB5 520 aa8.4□□□□□ -1.06
CCR6-202ENST00000349984 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CCR6-202ENST00000349984 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CCR6-202ENST00000349984 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.4□□□□□ -1.06
CCR6-202ENST00000349984 GLTPD2A6NH11 291 aa8.4□□□□□ -1.06
CCR6-202ENST00000349984 YDJCA8MPS7 323 aa8.4□□□□□ -1.06
CCR6-202ENST00000349984 PPIP5K2O43314 1243 aa8.4□□□□□ -1.06
CCR6-202ENST00000349984 ECEL1O95672 775 aa8.4□□□□□ -1.06
CCR6-202ENST00000349984 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa8.4□□□□□ -1.06
CCR6-202ENST00000349984 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CCR6-202ENST00000349984 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.4□□□□□ -1.06
CCR6-202ENST00000349984 KAZALD1Q96I82 304 aa8.4□□□□□ -1.06
CCR6-202ENST00000349984 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CCR6-202ENST00000349984 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CCR6-202ENST00000349984 PTPRCP08575 1304 aa8.4□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 H7C1W4 665 aa8.4□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 MYBL2P10244 700 aa8.4□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 RWDD2BP57060 319 aa8.4□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 NEXNQ0ZGT2 675 aa8.4□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.4□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 SUCLG2Q96I99 432 aa8.4□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 SH3GL3Q99963 347 aa8.4□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 MXD3Q9BW11 206 aa8.4□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 BRCA2P51587 3418 aa8.39□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 SETSIPP0DME0 302 aa8.39□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 FOXO4P98177 505 aa8.39□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 RNF214Q8ND24 703 aa8.39□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 STAG1Q8WVM7 1258 aa8.39□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.39□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 PDE8AO60658 829 aa8.39□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 TAF5LO75529 589 aa8.39□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 RARSP54136 660 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 TPM4P67936 248 aa8.39□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 CCDC186Q7Z3E2 898 aa8.39□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 JAG2Q9Y219 1238 aa8.39□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.39□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 WDR90Q96KV7 1748 aa8.38□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 C6orf229H3BNL8 230 aa8.38□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 EGFRP00533 1210 aa8.38□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 ITGA6P23229 1130 aa8.38□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 RPS8P62241 208 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 PSMD2Q13200 908 aa8.38□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 TBC1D25Q3MII6 688 aa8.38□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa8.38□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 LTBP3Q9NS15 1303 aa8.38□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 EPS15P42566 896 aa8.38□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 GRIK3Q13003 919 aa8.38□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 RTKN2Q8IZC4 609 aa8.38□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 LINS1Q8NG48 757 aa8.38□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 SMARCE1Q969G3 411 aa8.38□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 SYCE3A1L190 88 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 SGSM2O43147 1006 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 LMBR1LQ6UX01 489 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 SP8Q8IXZ3 490 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 TEX11Q8IYF3 940 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 TBC1D16Q8TBP0 767 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 LMBRD1Q9NUN5 540 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 FZD9O00144 591 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 UFL1O94874 794 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 PAX3P23760 479 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 RPS6KA3P51812 740 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 KIF2CQ99661 725 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 CDHR2Q9BYE9 1310 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 GRM8O00222 908 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 IVLP07476 585 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 SCNN1DP51172 638 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 CORO7P57737 925 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 CXCL9Q07325 125 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 SLC5A9Q2M3M2 681 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 CCDC152Q4G0S7 254 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 GTF3C6Q969F1 213 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 RMI1Q9H9A7 625 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 VEZTQ9HBM0 779 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-202ENST00000349984 GOPCQ9HD26 462 aa8.37□□□□□ -1.07
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