RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.09■■□□□ 1.77
SOCS1-201ENST00000332029 SLF2Q8IX21 1173 aa26.09■■□□□ 1.77
SOCS1-201ENST00000332029 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26.09■■□□□ 1.77
SOCS1-201ENST00000332029 A0A1B0GUL7 405 aa26.08■■□□□ 1.77
SOCS1-201ENST00000332029 PHF20L1A8MW92 1017 aa26.08■■□□□ 1.77
SOCS1-201ENST00000332029 CXCL11O14625 94 aa26.08■■□□□ 1.77
SOCS1-201ENST00000332029 CTGFP29279 349 aa26.08■■□□□ 1.77
SOCS1-201ENST00000332029 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
SOCS1-201ENST00000332029 SCYL3Q8IZE3 742 aa26.08■■□□□ 1.77
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.08■■□□□ 1.77
SOCS1-201ENST00000332029 TRIM47Q96LD4 638 aa26.08■■□□□ 1.77
SOCS1-201ENST00000332029 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
SOCS1-201ENST00000332029 AK9Q5TCS8 1911 aa26.08■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa26.07■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 XAGE2Q96GT9 111 aa26.07■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 PICK1Q9NRD5 415 aa26.07■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 SRRDQ9UH36 339 aa26.07■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 HOXD10P28358 340 aa26.06■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 BTDP43251 543 aa26.06■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 GPAT2Q6NUI2 795 aa26.06■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 ZHX2Q9Y6X8 837 aa26.06■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.05■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 OSBPP22059 807 aa26.05■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa26.05■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 CYP2C8P10632 490 aa26.04■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 PTPRAP18433 802 aa26.04■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 PICALMQ13492 652 aa26.04■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 RAET1EQ8TD07 263 aa26.04■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 MYH2Q9UKX2 1941 aa26.04■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 DOCK2Q92608 1830 aa26.03■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 MAP3K10Q02779 954 aa26.03■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.03■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 NEUROD6Q96NK8 337 aa26.03■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 BCRP11274 1271 aa26.02■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 MECOMQ03112 1051 aa26.02■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa26.02■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 MYPNQ86TC9 1320 aa26.02■■□□□ 1.76
SOCS1-201ENST00000332029 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.01■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 SLURP2P0DP57 97 aa26.01■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 GRK4P32298 578 aa26.01■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 MTFR1Q15390 333 aa26.01■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 GADL1Q6ZQY3 521 aa26.01■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 FCGRTP55899 365 aa26■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 RHBDL3P58872 404 aa26■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF384Q8TF68 577 aa26■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 HMG20BQ9P0W2 317 aa26■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 GORABQ5T7V8 394 aa25.99■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 PI16Q6UXB8 463 aa25.99■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa25.99■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.98■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 PRKCZQ05513 592 aa25.98■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 SPATA5Q8NB90 893 aa25.98■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 GSTO1P78417 241 aa25.97■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 POLA2Q14181 598 aa25.97■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.97■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 SHISA4Q96DD7 197 aa25.97■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 TRIM75PA6NK02 468 aa25.96■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 TBC1D12O60347 775 aa25.96■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 LDHCP07864 332 aa25.96■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 ATP8B2P98198 1209 aa25.96■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.96■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.96■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SOCS1-201ENST00000332029 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SOCS1-201ENST00000332029 RLBP1P12271 317 aa25.95■■□□□ 1.74
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SOCS1-201ENST00000332029 SSH3Q8TE77 659 aa25.95■■□□□ 1.74
SOCS1-201ENST00000332029 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.95■■□□□ 1.74
SOCS1-201ENST00000332029 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
SOCS1-201ENST00000332029 RAI14Q9P0K7 980 aa25.95■■□□□ 1.74
SOCS1-201ENST00000332029 DOCK1Q14185 1865 aa25.94■■□□□ 1.74
SOCS1-201ENST00000332029 FAM196BA6NMK8 535 aa25.94■■□□□ 1.74
SOCS1-201ENST00000332029 CCL5P13501 91 aa25.94■■□□□ 1.74
SOCS1-201ENST00000332029 UBXN2AP68543 259 aa25.94■■□□□ 1.74
SOCS1-201ENST00000332029 SLAIN1Q8ND83 568 aa25.94■■□□□ 1.74
SOCS1-201ENST00000332029 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SOCS1-201ENST00000332029 GABRQQ9UN88 632 aa25.94■■□□□ 1.74
SOCS1-201ENST00000332029 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SOCS1-201ENST00000332029 MCAMP43121 646 aa25.93■■□□□ 1.74
SOCS1-201ENST00000332029 RNF208Q9H0X6 261 aa25.93■■□□□ 1.74
SOCS1-201ENST00000332029 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SOCS1-201ENST00000332029 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 292.7 ms