RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 PICK1Q9NRD5 415 aa25.94■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 PDHXO00330 501 aa25.93■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 ATP8B2P98198 1209 aa25.93■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 PICALMQ13492 652 aa25.93■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 C17orf99Q6UX52 265 aa25.93■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.93■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.93■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 GPR108Q9NPR9 543 aa25.93■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.93■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.93■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 POTEFA5A3E0 1075 aa25.92■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 POLA2Q14181 598 aa25.92■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa25.92■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.92■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM106CQ9BVX2 250 aa25.92■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 RAI14Q9P0K7 980 aa25.92■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa25.92■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.92■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 PRMT2P55345 433 aa25.91■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 RHBDL3P58872 404 aa25.91■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 SSH3Q8TE77 659 aa25.91■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF384Q8TF68 577 aa25.91■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 DOCK2Q92608 1830 aa25.91■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 MCAMP43121 646 aa25.9■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 MOGSQ13724 837 aa25.9■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 PI16Q6UXB8 463 aa25.9■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa25.9■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.9■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 CPA4Q9UI42 421 aa25.9■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 TBC1D12O60347 775 aa25.89■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 SLC34A2O95436 690 aa25.89■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 PTPRAP18433 802 aa25.89■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.89■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF333Q96JL9 665 aa25.89■■□□□ 1.74
NEDD8-201ENST00000250495 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 TNNI3KQ59H18 835 aa25.88■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.88■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.88■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 HOXD10P28358 340 aa25.87■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.87■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.87■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.87■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 PSMC4P43686 418 aa25.86■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 EN2P19622 333 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.85■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 ADGRA2Q96PE1 1338 aa25.85■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 BAG3O95817 575 aa25.84■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 SLURP2P0DP57 97 aa25.84■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa25.84■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 TEX11Q8IYF3 940 aa25.84■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.84■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 SNRKQ9NRH2 765 aa25.84■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 SRRDQ9UH36 339 aa25.84■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa25.84■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 HTTP42858 3142 aa25.84■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 IGSF3O75054 1194 aa25.83■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 GADL1Q6ZQY3 521 aa25.83■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM47Q96LD4 638 aa25.83■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
NEDD8-201ENST00000250495 CYP2C8P10632 490 aa25.82■■□□□ 1.72
NEDD8-201ENST00000250495 RLBP1P12271 317 aa25.82■■□□□ 1.72
NEDD8-201ENST00000250495 SH3TC2Q8TF17 1288 aa25.82■■□□□ 1.72
NEDD8-201ENST00000250495 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
NEDD8-201ENST00000250495 BCRP11274 1271 aa25.81■■□□□ 1.72
NEDD8-201ENST00000250495 PLCG2P16885 1265 aa25.81■■□□□ 1.72
NEDD8-201ENST00000250495 CTGFP29279 349 aa25.81■■□□□ 1.72
NEDD8-201ENST00000250495 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa25.81■■□□□ 1.72
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM75PA6NK02 468 aa25.8■■□□□ 1.72
NEDD8-201ENST00000250495 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
NEDD8-201ENST00000250495 OSBPP22059 807 aa25.8■■□□□ 1.72
NEDD8-201ENST00000250495 PPP4CP60510 307 aa25.8■■□□□ 1.72
NEDD8-201ENST00000250495 RAET1EQ8TD07 263 aa25.8■■□□□ 1.72
NEDD8-201ENST00000250495 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
NEDD8-201ENST00000250495 DOCK1Q14185 1865 aa25.8■■□□□ 1.72
NEDD8-201ENST00000250495 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.8■■□□□ 1.72
NEDD8-201ENST00000250495 FCGRTP55899 365 aa25.79■■□□□ 1.72
NEDD8-201ENST00000250495 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.79■■□□□ 1.72
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