RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 GCC1Q96CN9 775 aa26.68■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 WRNIP1Q96S55 665 aa26.68■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 LRP2BPQ9P2M1 347 aa26.68■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa26.68■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa26.67■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 BTDP43251 543 aa26.67■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa26.67■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa26.67■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 ZNF333Q96JL9 665 aa26.67■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa26.67■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 HMMRO75330 724 aa26.66■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 LDHCP07864 332 aa26.66■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 MIGA2Q7L4E1 593 aa26.66■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.66■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa26.66■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 SNRKQ9NRH2 765 aa26.65■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 FAM198AQ9UFP1 575 aa26.65■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 ERO1BQ86YB8 467 aa26.64■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.64■■□□□ 1.86
NME4-201ENST00000219479 RGS3P49796 1198 aa26.63■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 ARHGEF6Q15052 776 aa26.63■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa26.63■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 IDI2Q9BXS1 227 aa26.63■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 BTBD19C9JJ37 291 aa26.62■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 IRF6O14896 467 aa26.62■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 ENTPD3O75355 529 aa26.62■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 CETPP11597 493 aa26.62■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 PICALMQ13492 652 aa26.62■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 PDE3AQ14432 1141 aa26.62■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 TMEM106CQ9BVX2 250 aa26.62■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 AK9Q5TCS8 1911 aa26.62■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.61■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 TLR2O60603 784 aa26.61■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 AACSQ86V21 672 aa26.61■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa26.61■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 APBB1O00213 710 aa26.6■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 PPIL2Q13356 520 aa26.6■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 SNAPC2Q13487 334 aa26.6■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 ZFPM1Q8IX07 1006 aa26.6■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 NBPF11Q86T75 865 aa26.59■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 CEP290O15078 2479 aa26.58■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.58■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 RHPN1Q8TCX5 695 aa26.58■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 ZNF384Q8TF68 577 aa26.58■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 BCL11AQ9H165 835 aa26.58■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.58■■□□□ 1.85
NME4-201ENST00000219479 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 INPP5BP32019 993 aa26.57■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 ZAP70P43403 619 aa26.57■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.57■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 BAG3O95817 575 aa26.56■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 KIF22Q14807 665 aa26.56■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 MYH2Q9UKX2 1941 aa26.56■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 RFX7Q2KHR2 1363 aa26.56■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 MYCP01106 439 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 RHBDL3P58872 404 aa26.55■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 PPATQ06203 517 aa26.55■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.55■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 TEX11Q8IYF3 940 aa26.55■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 SH3TC2Q8TF17 1288 aa26.55■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 PLCG2P16885 1265 aa26.54■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.54■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 ZNF112Q9UJU3 913 aa26.54■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 DOCK2Q92608 1830 aa26.53■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 IGSF3O75054 1194 aa26.53■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 RAB11FIP3O75154 756 aa26.53■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 IDH1O75874 414 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.842e-6■■■□□ 18.9
NME4-201ENST00000219479 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 NPM3O75607 178 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 GNRH1P01148 92 aa26.52■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 C17orf99Q6UX52 265 aa26.52■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa26.52■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 PICK1Q9NRD5 415 aa26.52■■□□□ 1.84
NME4-201ENST00000219479 ADGRA2Q96PE1 1338 aa26.51■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 CTGFP29279 349 aa26.51■■□□□ 1.83
NME4-201ENST00000219479 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms