RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM29Q14134 588 aa25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 LY9Q9HBG7 655 aa25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 B4E1Z4 1266 aa25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 CNNM3Q8NE01 707 aa25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 FHOD1Q9Y613 1164 aa25.46■■□□□ 1.67
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HTATSF1-201ENST00000218364 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.46■■□□□ 1.67
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HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa25.46■■□□□ 1.67
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HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM232C9JQI7 657 aa25.45■■□□□ 1.67
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HTATSF1-201ENST00000218364 MICU3Q86XE3 530 aa25.45■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
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HTATSF1-201ENST00000218364 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.44■■□□□ 1.66
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HTATSF1-201ENST00000218364 PDE4BQ07343 736 aa25.44■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.44■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 UBXN4Q92575 508 aa25.44■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.43■■□□□ 1.66
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HTATSF1-201ENST00000218364 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 NID2Q14112 1375 aa25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 LRP6O75581 1613 aa25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 TADA3O75528 432 aa25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 PDE6AP16499 860 aa25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 ITGA6P23229 1130 aa25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.43■■□□□ 1.66
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HTATSF1-201ENST00000218364 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM67Q5HYA8 995 aa25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 NT5DC1Q5TFE4 455 aa25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 EFCAB8A8MWE9 144 aa25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
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HTATSF1-201ENST00000218364 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.42■■□□□ 1.66
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HTATSF1-201ENST00000218364 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
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HTATSF1-201ENST00000218364 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF18P17022 549 aa25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 IFNAR1P17181 557 aa25.4■■□□□ 1.66
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HTATSF1-201ENST00000218364 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 MAN1B1Q9UKM7 699 aa25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.4■■□□□ 1.66
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HTATSF1-201ENST00000218364 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa25.4■■□□□ 1.66
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HTATSF1-201ENST00000218364 FOXN1O15353 648 aa25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 STX10O60499 249 aa25.39■■□□□ 1.66
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HTATSF1-201ENST00000218364 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.39■■□□□ 1.66
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HTATSF1-201ENST00000218364 MMP1P03956 469 aa25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.39■■□□□ 1.66
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HTATSF1-201ENST00000218364 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 SYNE4Q8N205 404 aa25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 MYL10Q9BUA6 226 aa25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 ST7Q9NRC1 585 aa25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1-201ENST00000218364 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 CTSWP56202 376 aa25.39■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 POSTNQ15063 836 aa25.39■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 ZSWIM5Q9P217 1185 aa25.39■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
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