RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617928.4

CYFIP1-208, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 6,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CYFIP1-208	ENST00000617928	TMC1	Q8TDI8	760 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CYFIP1-208	ENST00000617928	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CYFIP1-208	ENST00000617928	KCNH8	Q96L42	1107 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CYFIP1-208	ENST00000617928	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CYFIP1-208	ENST00000617928	FKBP8	Q14318	412 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CYFIP1-208	ENST00000617928	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
CYFIP1-208	ENST00000617928	NPHP1	O15259	732 aa		11.56	□□□□□ -0.56
CYFIP1-208	ENST00000617928	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		11.54	□□□□□ -0.56
CYFIP1-208	ENST00000617928	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		11.52	□□□□□ -0.57
CYFIP1-208	ENST00000617928	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
CYFIP1-208	ENST00000617928	MRS2	Q9HD23	443 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CYFIP1-208	ENST00000617928	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		11.48	□□□□□ -0.57
CYFIP1-208	ENST00000617928	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CYFIP1-208	ENST00000617928	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
CYFIP1-208	ENST00000617928	NBR1	Q14596	966 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CYFIP1-208	ENST00000617928	RGL3	Q3MIN7	710 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CYFIP1-208	ENST00000617928	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CYFIP1-208	ENST00000617928	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
CYFIP1-208	ENST00000617928	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CYFIP1-208	ENST00000617928	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CYFIP1-208	ENST00000617928	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CYFIP1-208	ENST00000617928	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CYFIP1-208	ENST00000617928	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CYFIP1-208	ENST00000617928	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CYFIP1-208	ENST00000617928	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CYFIP1-208	ENST00000617928	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CYFIP1-208	ENST00000617928	CFAP53	Q96M91	514 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CYFIP1-208	ENST00000617928	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CYFIP1-208	ENST00000617928	POGK	Q9P215	609 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CYFIP1-208	ENST00000617928	GOLGA2	Q08379	1002 aa		11.37	□□□□□ -0.59
CYFIP1-208	ENST00000617928	CASC1	Q6TDU7	716 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CYFIP1-208	ENST00000617928	NEUROD2	Q15784	382 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CYFIP1-208	ENST00000617928	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	11.35	□□□□□ -0.59	5e-10	■■■■■ 65.4
CYFIP1-208	ENST00000617928	MLEC	Q14165	292 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CYFIP1-208	ENST00000617928	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
CYFIP1-208	ENST00000617928	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CYFIP1-208	ENST00000617928	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
CYFIP1-208	ENST00000617928	CLSTN1	O94985	981 aa		11.33	□□□□□ -0.59
CYFIP1-208	ENST00000617928	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.59
CYFIP1-208	ENST00000617928	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		11.33	□□□□□ -0.59
CYFIP1-208	ENST00000617928	BECN1	Q14457	450 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CYFIP1-208	ENST00000617928	SOX12	O15370	315 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CYFIP1-208	ENST00000617928	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CYFIP1-208	ENST00000617928	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CYFIP1-208	ENST00000617928	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CYFIP1-208	ENST00000617928	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CYFIP1-208	ENST00000617928	CDCA8	Q53HL2	280 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CYFIP1-208	ENST00000617928	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CYFIP1-208	ENST00000617928	FGD1	P98174	961 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CYFIP1-208	ENST00000617928	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CYFIP1-208	ENST00000617928	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CYFIP1-208	ENST00000617928	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CYFIP1-208	ENST00000617928	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CYFIP1-208	ENST00000617928	NUDC	Q9Y266	331 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CYFIP1-208	ENST00000617928	ERCC6	Q03468	1493 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CYFIP1-208	ENST00000617928	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.6
CYFIP1-208	ENST00000617928	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.6
CYFIP1-208	ENST00000617928	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CYFIP1-208	ENST00000617928	KCNJ4	P48050	445 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CYFIP1-208	ENST00000617928	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CYFIP1-208	ENST00000617928	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
CYFIP1-208	ENST00000617928	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
CYFIP1-208	ENST00000617928	PLCB2	Q00722	1185 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CYFIP1-208	ENST00000617928	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
CYFIP1-208	ENST00000617928	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
CYFIP1-208	ENST00000617928	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
CYFIP1-208	ENST00000617928	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
CYFIP1-208	ENST00000617928	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61
CYFIP1-208	ENST00000617928	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CYFIP1-208	ENST00000617928	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
CYFIP1-208	ENST00000617928	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CYFIP1-208	ENST00000617928	CLIP1	P30622	1438 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CYFIP1-208	ENST00000617928	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CYFIP1-208	ENST00000617928	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CYFIP1-208	ENST00000617928	RGS3	P49796	1198 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP1-208	ENST00000617928	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP1-208	ENST00000617928	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP1-208	ENST00000617928	MIER1	Q8N108	512 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP1-208	ENST00000617928	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP1-208	ENST00000617928	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP1-208	ENST00000617928	STK26	Q9P289	416 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP1-208	ENST00000617928	SMARCA2	P51531	1590 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP1-208	ENST00000617928	KANK1	Q14678	1352 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP1-208	ENST00000617928	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP1-208	ENST00000617928	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP1-208	ENST00000617928	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
CYFIP1-208	ENST00000617928	GGT6	Q6P531	493 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CYFIP1-208	ENST00000617928	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYFIP1-208	ENST00000617928	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CYFIP1-208	ENST00000617928	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYFIP1-208	ENST00000617928		G3V3G9	751 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYFIP1-208	ENST00000617928	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYFIP1-208	ENST00000617928	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CYFIP1-208	ENST00000617928	MS4A1	P11836	297 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CYFIP1-208	ENST00000617928	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CYFIP1-208	ENST00000617928	APBB1	O00213	710 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CYFIP1-208	ENST00000617928	TMF1	P82094	1093 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CYFIP1-208	ENST00000617928	MORC1	Q86VD1	984 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CYFIP1-208	ENST00000617928	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CYFIP1-208	ENST00000617928	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms