RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617631.1

5S_rRNA.12-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 107 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NCLP19338 710 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa4.83□□□□□ -1.64
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PTMSP20962 102 aa4.81□□□□□ -1.64
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NEFMP07197 916 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MCCP23508 829 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TEX2Q8IWB9 1127 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZMYND15Q9H091 742 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CANXP27824 592 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZNF592Q92610 1267 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MAFGO15525 162 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 GRIPAP1Q4V328 841 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RGS22Q8NE09 1264 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PLCD4Q9BRC7 762 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NECTIN2Q92692 538 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 FOXD4L1Q9NU39 408 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PTMAP06454 111 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RBM10P98175 930 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CERS3Q8IU89 383 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 KCTD17Q8N5Z5 321 aa4.75□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RAD21O60216 631 aa4.74□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NPM3O75607 178 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 VGFO15240 615 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CFAP44Q96MT7 982 aa4.73□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa4.72□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 E9PSI1 815 aa4.71□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CCDC136Q96JN2 1154 aa4.71□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa4.71□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 BRPF3Q9ULD4 1205 aa4.71□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CCDC125Q86Z20 511 aa4.7□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TRAIPQ9BWF2 469 aa4.7□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa4.69□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa4.68□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PHF14O94880 888 aa4.68□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ANAPC15P60006 121 aa4.68□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CCDC27Q2M243 656 aa4.68□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa4.68□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TMCO4Q5TGY1 634 aa4.67□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PLEKHD1A6NEE1 506 aa4.66□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ADRA2BP18089 450 aa4.66□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RBM25P49756 843 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 EXOC8Q8IYI6 725 aa4.66□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CNPY4Q8N129 248 aa4.66□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MTMR7Q9Y216 660 aa4.66□□□□□ -1.66
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CLGNO14967 610 aa4.65□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PKD2Q13563 968 aa4.65□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 GPATCH11Q8N954 259 aa4.65□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 USP35Q9P2H5 1018 aa4.65□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DEKP35659 375 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP4.64□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 C1orf115Q9H7X2 142 aa4.64□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CADPSQ9ULU8 1353 aa4.63□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ATXN8OSP0DMR3 200 aa4.62□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa4.62□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ERCC3P19447 782 aa4.61□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MMP14P50281 582 aa4.61□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa4.61□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa4.61□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 NEUROD2Q15784 382 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CEP120Q8N960 986 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PRDM10Q9NQV6 1147 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CALRP27797 417 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 FAM193AP78312 1265 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 MYH16Q9H6N6 1097 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 DNAJC5BQ9UF47 199 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.12-201ENST00000617631 APBB1O00213 710 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms