RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599427.5

PCBP1-AS1-253, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 662 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 DCAF8Q5TAQ9 597 aa10.19□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 FAM212AQ96EL1 285 aa10.16□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 STK25O00506 426 aa10.13□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 VGFO15240 615 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 NUBP1P53384 320 aa10.11□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 POTEDQ86YR6 584 aa10.07□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 PRR29P0C7W0 189 aa10.05□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 CLEC11AQ9Y240 323 aa10.03□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 P3H3Q8IVL6 736 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 STK24Q9Y6E0 443 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 SGIP1Q9BQI5 828 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 ERICH6Q7L0X2 663 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 AKT1S1Q96B36 256 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 CREBZFQ9NS37 354 aa9.96□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 WDR70Q9NW82 654 aa9.95□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 RASEFQ8IZ41 740 aa9.92□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 PYGBP11216 843 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.86□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.82□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.77□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.76□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 PITPNM1O00562 1244 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 PSEN1P49768 467 aa9.68□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 C14orf37Q86TY3 774 aa9.68□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 ARXQ96QS3 562 aa9.68□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa9.67□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.67□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.67□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 E2F4Q16254 413 aa9.66□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 NLRP6P59044 892 aa9.65□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 MFRPQ9BY79 579 aa9.65□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.63□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 SOX12O15370 315 aa9.62□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 CHADLQ6NUI6 762 aa9.62□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.59□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 NEUROD2Q15784 382 aa9.58□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 CABP2Q9NPB3 220 aa9.57□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.56□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 PDE4AP27815 886 aa9.55□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 SEMA3EO15041 775 aa9.54□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 PPP1R37O75864 691 aa9.53□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.53□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 GOLGA2Q08379 1002 aa9.52□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 IFNL1Q8IU54 200 aa9.52□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 HOMEZQ8IX15 550 aa9.52□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.52□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.51□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa9.49□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 MAP3K13O43283 966 aa9.48□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 ZMYND10O75800 440 aa9.46□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KIF12Q96FN5 646 aa9.46□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 MFSD10Q14728 455 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 BARGINQ6ZT62 677 aa9.4□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 AK7Q96M32 723 aa9.4□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.4□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 MYO15BQ96JP2 1530 aa9.4□□□□□ -0.91
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.39□□□□□ -0.91
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 CAMK2BQ13554 666 aa9.37□□□□□ -0.91
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 HRCP23327 699 aa9.36□□□□□ -0.91
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.36□□□□□ -0.91
PCBP1-AS1-253ENST00000599427 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.1 ms