RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572085.5

TP53BP1-216, Transcript of tumor protein p53 binding protein 1, human

TSL 2

Gene TP53BP1, Length 5,574 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TP53BP1-216	ENST00000572085	SCRIB	Q14160	1630 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TP53BP1-216	ENST00000572085	FOXD1	Q16676	465 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TP53BP1-216	ENST00000572085	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TP53BP1-216	ENST00000572085	TONSL	Q96HA7	1378 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TP53BP1-216	ENST00000572085	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TP53BP1-216	ENST00000572085	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TP53BP1-216	ENST00000572085	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TP53BP1-216	ENST00000572085	CFAP53	Q96M91	514 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TP53BP1-216	ENST00000572085	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TP53BP1-216	ENST00000572085	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TP53BP1-216	ENST00000572085	HRC	P23327	699 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TP53BP1-216	ENST00000572085	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TP53BP1-216	ENST00000572085	CDCA8	Q53HL2	280 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TP53BP1-216	ENST00000572085	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TP53BP1-216	ENST00000572085	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TP53BP1-216	ENST00000572085		G3V3G9	751 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TP53BP1-216	ENST00000572085	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TP53BP1-216	ENST00000572085	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
TP53BP1-216	ENST00000572085	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
TP53BP1-216	ENST00000572085	KANK1	Q14678	1352 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TP53BP1-216	ENST00000572085	CLSTN1	O94985	981 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TP53BP1-216	ENST00000572085	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TP53BP1-216	ENST00000572085	RGL3	Q3MIN7	710 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TP53BP1-216	ENST00000572085	EID1	Q9Y6B2	187 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TP53BP1-216	ENST00000572085	NUDC	Q9Y266	331 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TP53BP1-216	ENST00000572085	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TP53BP1-216	ENST00000572085	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TP53BP1-216	ENST00000572085	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TP53BP1-216	ENST00000572085	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TP53BP1-216	ENST00000572085	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TP53BP1-216	ENST00000572085	MSH5	O43196	834 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TP53BP1-216	ENST00000572085	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TP53BP1-216	ENST00000572085	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TP53BP1-216	ENST00000572085	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TP53BP1-216	ENST00000572085	SOX12	O15370	315 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TP53BP1-216	ENST00000572085	GGT6	Q6P531	493 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TP53BP1-216	ENST00000572085	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TP53BP1-216	ENST00000572085	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		13.21	□□□□□ -0.3
TP53BP1-216	ENST00000572085	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.3
TP53BP1-216	ENST00000572085	KLHL34	Q8N239	644 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TP53BP1-216	ENST00000572085	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TP53BP1-216	ENST00000572085	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TP53BP1-216	ENST00000572085	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TP53BP1-216	ENST00000572085	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TP53BP1-216	ENST00000572085	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TP53BP1-216	ENST00000572085	CASC1	Q6TDU7	716 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TP53BP1-216	ENST00000572085	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TP53BP1-216	ENST00000572085	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TP53BP1-216	ENST00000572085	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TP53BP1-216	ENST00000572085	FGD1	P98174	961 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TP53BP1-216	ENST00000572085	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TP53BP1-216	ENST00000572085	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TP53BP1-216	ENST00000572085	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TP53BP1-216	ENST00000572085	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TP53BP1-216	ENST00000572085	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TP53BP1-216	ENST00000572085	EVA1C	P58658	441 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TP53BP1-216	ENST00000572085	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TP53BP1-216	ENST00000572085	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TP53BP1-216	ENST00000572085	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TP53BP1-216	ENST00000572085	KCNJ4	P48050	445 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TP53BP1-216	ENST00000572085	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.31
TP53BP1-216	ENST00000572085	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TP53BP1-216	ENST00000572085	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TP53BP1-216	ENST00000572085	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TP53BP1-216	ENST00000572085	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TP53BP1-216	ENST00000572085	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TP53BP1-216	ENST00000572085	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TP53BP1-216	ENST00000572085	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TP53BP1-216	ENST00000572085	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	13.06	□□□□□ -0.32
TP53BP1-216	ENST00000572085	STK26	Q9P289	416 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TP53BP1-216	ENST00000572085	CLIP1	P30622	1438 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TP53BP1-216	ENST00000572085	FKBP8	Q14318	412 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TP53BP1-216	ENST00000572085	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TP53BP1-216	ENST00000572085	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TP53BP1-216	ENST00000572085	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TP53BP1-216	ENST00000572085	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	13.04	□□□□□ -0.32
TP53BP1-216	ENST00000572085	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TP53BP1-216	ENST00000572085	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TP53BP1-216	ENST00000572085	MRS2	Q9HD23	443 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TP53BP1-216	ENST00000572085	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TP53BP1-216	ENST00000572085	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.32
TP53BP1-216	ENST00000572085	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
TP53BP1-216	ENST00000572085	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TP53BP1-216	ENST00000572085	NEUROD2	Q15784	382 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TP53BP1-216	ENST00000572085	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TP53BP1-216	ENST00000572085	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
TP53BP1-216	ENST00000572085	GORAB	Q5T7V8	394 aa		13	□□□□□ -0.33
TP53BP1-216	ENST00000572085	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TP53BP1-216	ENST00000572085	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TP53BP1-216	ENST00000572085	MS4A1	P11836	297 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TP53BP1-216	ENST00000572085	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TP53BP1-216	ENST00000572085	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TP53BP1-216	ENST00000572085	KIF27	Q86VH2	1401 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TP53BP1-216	ENST00000572085	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
TP53BP1-216	ENST00000572085	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		12.96	□□□□□ -0.34
TP53BP1-216	ENST00000572085	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TP53BP1-216	ENST00000572085	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
TP53BP1-216	ENST00000572085	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
TP53BP1-216	ENST00000572085	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TP53BP1-216	ENST00000572085	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		12.94	□□□□□ -0.34

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