RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558714.5

TMOD3-205, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-205ENST00000558714 KLHL34Q8N239 644 aa7.61□□□□□ -1.19
TMOD3-205ENST00000558714 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
TMOD3-205ENST00000558714 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
TMOD3-205ENST00000558714 FAM212AQ96EL1 285 aa7.57□□□□□ -1.2
TMOD3-205ENST00000558714 PHF12Q96QT6 1004 aa7.57□□□□□ -1.2
TMOD3-205ENST00000558714 CCDC61Q9Y6R9 512 aa7.57□□□□□ -1.2
TMOD3-205ENST00000558714 SPOCK2Q92563 424 aa7.54□□□□□ -1.2
TMOD3-205ENST00000558714 GSE1Q14687 1217 aa7.52□□□□□ -1.21
TMOD3-205ENST00000558714 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.52□□□□□ -1.21
TMOD3-205ENST00000558714 KIF12Q96FN5 646 aa7.52□□□□□ -1.21
TMOD3-205ENST00000558714 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-205ENST00000558714 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.49□□□□□ -1.21
TMOD3-205ENST00000558714 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.48□□□□□ -1.21
TMOD3-205ENST00000558714 MAP3K13O43283 966 aa7.47□□□□□ -1.21
TMOD3-205ENST00000558714 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.47□□□□□ -1.21
TMOD3-205ENST00000558714 POTEIP0CG38 1075 aa7.45□□□□□ -1.22
TMOD3-205ENST00000558714 PYGBP11216 843 aa7.43□□□□□ -1.22
TMOD3-205ENST00000558714 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
TMOD3-205ENST00000558714 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
TMOD3-205ENST00000558714 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.43□□□□□ -1.22
TMOD3-205ENST00000558714 TRIM41Q8WV44 630 aa7.41□□□□□ -1.22
TMOD3-205ENST00000558714 TIE1P35590 1138 aa7.4□□□□□ -1.22
TMOD3-205ENST00000558714 PKD2Q13563 968 aa7.4□□□□□ -1.22
TMOD3-205ENST00000558714 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TMOD3-205ENST00000558714 IFNL1Q8IU54 200 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD3-205ENST00000558714 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TMOD3-205ENST00000558714 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TMOD3-205ENST00000558714 TRPC6Q9Y210 931 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD3-205ENST00000558714 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-205ENST00000558714 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-205ENST00000558714 PCDHB8Q9UN66 801 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-205ENST00000558714 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-205ENST00000558714 SLC39A7Q92504 469 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-205ENST00000558714 DCAF8L2P0C7V8 631 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-205ENST00000558714 C7P10643 843 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-205ENST00000558714 TMEM106CQ9BVX2 250 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-205ENST00000558714 PLCB2Q00722 1185 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-205ENST00000558714 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-205ENST00000558714 IER5LQ5T953 404 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-205ENST00000558714 METRNQ9UJH8 293 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-205ENST00000558714 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-205ENST00000558714 PSEN1P49768 467 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-205ENST00000558714 LHX8Q68G74 356 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-205ENST00000558714 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-205ENST00000558714 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-205ENST00000558714 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TMOD3-205ENST00000558714 VGFO15240 615 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-205ENST00000558714 TAOK2Q9UL54 1235 aa7.23□□□□□ -1.25
TMOD3-205ENST00000558714 RGL2O15211 777 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-205ENST00000558714 SEC24BO95487 1268 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-205ENST00000558714 GOLGA2Q08379 1002 aa7.21□□□□□ -1.26
TMOD3-205ENST00000558714 POTEFA5A3E0 1075 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD3-205ENST00000558714 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TMOD3-205ENST00000558714 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TMOD3-205ENST00000558714 POTEB2H3BUK9 544 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD3-205ENST00000558714 PLCG2P16885 1265 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD3-205ENST00000558714 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TMOD3-205ENST00000558714 OCEL1Q9H607 264 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD3-205ENST00000558714 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TMOD3-205ENST00000558714 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TMOD3-205ENST00000558714 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TMOD3-205ENST00000558714 CABP2Q9NPB3 220 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD3-205ENST00000558714 MAMSTRQ6ZN01 415 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-205ENST00000558714 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TMOD3-205ENST00000558714 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TMOD3-205ENST00000558714 POTEJP0CG39 1038 aa7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-205ENST00000558714 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
TMOD3-205ENST00000558714 OTUD5Q96G74 571 aa7.13□□□□□ -1.27
TMOD3-205ENST00000558714 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TMOD3-205ENST00000558714 EFCAB3Q8N7B9 438 aa7.12□□□□□ -1.27
TMOD3-205ENST00000558714 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TMOD3-205ENST00000558714 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TMOD3-205ENST00000558714 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.12□□□□□ -1.27
TMOD3-205ENST00000558714 STK25O00506 426 aa7.11□□□□□ -1.27
TMOD3-205ENST00000558714 SOX12O15370 315 aa7.11□□□□□ -1.27
TMOD3-205ENST00000558714 STK24Q9Y6E0 443 aa7.1□□□□□ -1.27
TMOD3-205ENST00000558714 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TMOD3-205ENST00000558714 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TMOD3-205ENST00000558714 CHGAP10645 457 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
TMOD3-205ENST00000558714 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.08□□□□□ -1.28
TMOD3-205ENST00000558714 CFAP44Q96MT7 982 aa7.07□□□□□ -1.28
TMOD3-205ENST00000558714 HS6ST3Q8IZP7 471 aa7.06□□□□□ -1.28
TMOD3-205ENST00000558714 NLRP6P59044 892 aa7.05□□□□□ -1.28
TMOD3-205ENST00000558714 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.04□□□□□ -1.28
TMOD3-205ENST00000558714 PHF8Q9UPP1 1060 aa7.04□□□□□ -1.28
TMOD3-205ENST00000558714 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.03□□□□□ -1.28
TMOD3-205ENST00000558714 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
TMOD3-205ENST00000558714 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.03□□□□□ -1.28
TMOD3-205ENST00000558714 G3V3G9 751 aa7.02□□□□□ -1.29
TMOD3-205ENST00000558714 C3orf67Q6ZVT6 689 aa7.02□□□□□ -1.29
TMOD3-205ENST00000558714 FBXO22Q8NEZ5 403 aa7.02□□□□□ -1.29
TMOD3-205ENST00000558714 MS4A4AQ96JQ5 239 aa7.02□□□□□ -1.29
TMOD3-205ENST00000558714 MFRPQ9BY79 579 aa7.02□□□□□ -1.29
TMOD3-205ENST00000558714 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa7.02□□□□□ -1.29
TMOD3-205ENST00000558714 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.02□□□□□ -1.29
TMOD3-205ENST00000558714 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-205ENST00000558714 SLAIN1Q8ND83 568 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-205ENST00000558714 BCANQ96GW7 911 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-205ENST00000558714 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms