RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
COPS5-208	ENST00000519057	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
COPS5-208	ENST00000519057	KLHL34	Q8N239	644 aa		14.66	□□□□□ -0.06
COPS5-208	ENST00000519057	POTEI	P0CG38	1075 aa		14.65	□□□□□ -0.06
COPS5-208	ENST00000519057	FAM212A	Q96EL1	285 aa		14.63	□□□□□ -0.07
COPS5-208	ENST00000519057	KIF12	Q96FN5	646 aa		14.63	□□□□□ -0.07
COPS5-208	ENST00000519057	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		14.61	□□□□□ -0.07
COPS5-208	ENST00000519057	MAP3K13	O43283	966 aa		14.56	□□□□□ -0.08
COPS5-208	ENST00000519057	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		14.54	□□□□□ -0.08
COPS5-208	ENST00000519057	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS5-208	ENST00000519057	SPOCK2	Q92563	424 aa		14.53	□□□□□ -0.08
COPS5-208	ENST00000519057	TRPC6	Q9Y210	931 aa		14.47	□□□□□ -0.09
COPS5-208	ENST00000519057	GSE1	Q14687	1217 aa		14.46	□□□□□ -0.09
COPS5-208	ENST00000519057	PYGB	P11216	843 aa		14.45	□□□□□ -0.1
COPS5-208	ENST00000519057	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		14.45	□□□□□ -0.1
COPS5-208	ENST00000519057	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		14.44	□□□□□ -0.1
COPS5-208	ENST00000519057	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	14.43	□□□□□ -0.1
COPS5-208	ENST00000519057	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	14.41	□□□□□ -0.1
COPS5-208	ENST00000519057	IFNL1	Q8IU54	200 aa		14.41	□□□□□ -0.1
COPS5-208	ENST00000519057	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	14.4	□□□□□ -0.1
COPS5-208	ENST00000519057	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	14.38	□□□□□ -0.11
COPS5-208	ENST00000519057	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	14.35	□□□□□ -0.11
COPS5-208	ENST00000519057	TIE1	P35590	1138 aa		14.35	□□□□□ -0.11
COPS5-208	ENST00000519057	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	14.35	□□□□□ -0.11
COPS5-208	ENST00000519057	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	14.33	□□□□□ -0.12
COPS5-208	ENST00000519057	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		14.31	□□□□□ -0.12
COPS5-208	ENST00000519057	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		14.3	□□□□□ -0.12
COPS5-208	ENST00000519057	LHX8	Q68G74	356 aa		14.26	□□□□□ -0.13
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	14.23	□□□□□ -0.13
COPS5-208	ENST00000519057	SLC39A7	Q92504	469 aa		14.23	□□□□□ -0.13
COPS5-208	ENST00000519057	METRN	Q9UJH8	293 aa		14.23	□□□□□ -0.13
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		14.22	□□□□□ -0.13
COPS5-208	ENST00000519057	C7	P10643	843 aa		14.21	□□□□□ -0.13
COPS5-208	ENST00000519057	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		14.2	□□□□□ -0.14
COPS5-208	ENST00000519057	TRIM41	Q8WV44	630 aa		14.19	□□□□□ -0.14
COPS5-208	ENST00000519057	POTEB2	H3BUK9	544 aa		14.18	□□□□□ -0.14
COPS5-208	ENST00000519057	POTEF	A5A3E0	1075 aa		14.15	□□□□□ -0.14
COPS5-208	ENST00000519057	PSEN1	P49768	467 aa		14.11	□□□□□ -0.15
COPS5-208	ENST00000519057	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	14.11	□□□□□ -0.15
COPS5-208	ENST00000519057	IER5L	Q5T953	404 aa		14.1	□□□□□ -0.15
COPS5-208	ENST00000519057	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	14.09	□□□□□ -0.15
COPS5-208	ENST00000519057	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
COPS5-208	ENST00000519057	POTEJ	P0CG39	1038 aa		14.07	□□□□□ -0.16
COPS5-208	ENST00000519057	PKD2	Q13563	968 aa		14.07	□□□□□ -0.16
COPS5-208	ENST00000519057	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	14.02	□□□□□ -0.17
COPS5-208	ENST00000519057	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.17
COPS5-208	ENST00000519057	OTUD5	Q96G74	571 aa		14.01	□□□□□ -0.17
COPS5-208	ENST00000519057	SEC24B	O95487	1268 aa		14	□□□□□ -0.17
COPS5-208	ENST00000519057	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
COPS5-208	ENST00000519057	PLCG2	P16885	1265 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS5-208	ENST00000519057	CABP2	Q9NPB3	220 aa		13.93	□□□□□ -0.18
COPS5-208	ENST00000519057	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
COPS5-208	ENST00000519057	OCEL1	Q9H607	264 aa		13.92	□□□□□ -0.18
COPS5-208	ENST00000519057	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
COPS5-208	ENST00000519057	RGL2	O15211	777 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS5-208	ENST00000519057	GOLGA2	Q08379	1002 aa		13.91	□□□□□ -0.18
COPS5-208	ENST00000519057	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
COPS5-208	ENST00000519057	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
COPS5-208	ENST00000519057	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
COPS5-208	ENST00000519057	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
COPS5-208	ENST00000519057	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		13.86	□□□□□ -0.19
COPS5-208	ENST00000519057	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	13.84	□□□□□ -0.19	3e-9	■■□□□ 13.2
COPS5-208	ENST00000519057	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		13.83	□□□□□ -0.2
COPS5-208	ENST00000519057	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		13.82	□□□□□ -0.2
COPS5-208	ENST00000519057	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
COPS5-208	ENST00000519057	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.79	□□□□□ -0.2
COPS5-208	ENST00000519057	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		13.76	□□□□□ -0.21
COPS5-208	ENST00000519057	STK25	O00506	426 aa		13.74	□□□□□ -0.21
COPS5-208	ENST00000519057	STK24	Q9Y6E0	443 aa		13.73	□□□□□ -0.21
COPS5-208	ENST00000519057	SOX12	O15370	315 aa		13.71	□□□□□ -0.21
COPS5-208	ENST00000519057	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
COPS5-208	ENST00000519057	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		13.69	□□□□□ -0.22
COPS5-208	ENST00000519057	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.68	□□□□□ -0.22
COPS5-208	ENST00000519057	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		13.64	□□□□□ -0.23
COPS5-208	ENST00000519057	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		13.64	□□□□□ -0.23
COPS5-208	ENST00000519057	MFRP	Q9BY79	579 aa		13.63	□□□□□ -0.23
COPS5-208	ENST00000519057	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		13.63	□□□□□ -0.23
COPS5-208	ENST00000519057	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
COPS5-208	ENST00000519057	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		13.6	□□□□□ -0.23
COPS5-208	ENST00000519057	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		13.6	□□□□□ -0.23
COPS5-208	ENST00000519057	NLRP6	P59044	892 aa		13.59	□□□□□ -0.23
COPS5-208	ENST00000519057	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
COPS5-208	ENST00000519057	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
COPS5-208	ENST00000519057	MICALL2	Q8IY33	904 aa		13.54	□□□□□ -0.24
COPS5-208	ENST00000519057		G3V3G9	751 aa		13.52	□□□□□ -0.25
COPS5-208	ENST00000519057	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
COPS5-208	ENST00000519057	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		13.49	□□□□□ -0.25
COPS5-208	ENST00000519057	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		13.46	□□□□□ -0.25
COPS5-208	ENST00000519057	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
COPS5-208	ENST00000519057	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
COPS5-208	ENST00000519057	PPP1R37	O75864	691 aa		13.42	□□□□□ -0.26
COPS5-208	ENST00000519057	ST18	O60284	1047 aa		13.4	□□□□□ -0.26
COPS5-208	ENST00000519057	POTEM	A6NI47	508 aa		13.39	□□□□□ -0.27
COPS5-208	ENST00000519057	POTEG	Q6S5H5	508 aa		13.39	□□□□□ -0.27
COPS5-208	ENST00000519057	SNPH	O15079	494 aa		13.38	□□□□□ -0.27
COPS5-208	ENST00000519057	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		13.37	□□□□□ -0.27
COPS5-208	ENST00000519057	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
COPS5-208	ENST00000519057	KIF3C	O14782	793 aa		13.3	□□□□□ -0.28

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