RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516721.1

RNU6-965P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 965, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-965P, Length 96 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-965P-201ENST00000516721 CHGAP10645 457 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-965P-201ENST00000516721 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-965P-201ENST00000516721 NUBP1P53384 320 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-965P-201ENST00000516721 DCAF8Q5TAQ9 597 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-965P-201ENST00000516721 CFAP44Q96MT7 982 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-965P-201ENST00000516721 CLEC11AQ9Y240 323 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-965P-201ENST00000516721 VGFO15240 615 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-965P-201ENST00000516721 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-965P-201ENST00000516721 SGIP1Q9BQI5 828 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-965P-201ENST00000516721 CREBZFQ9NS37 354 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-965P-201ENST00000516721 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-965P-201ENST00000516721 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-965P-201ENST00000516721 STK25O00506 426 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-965P-201ENST00000516721 PITPNM1O00562 1244 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-965P-201ENST00000516721 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-965P-201ENST00000516721 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-965P-201ENST00000516721 NBR1Q14596 966 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-965P-201ENST00000516721 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-965P-201ENST00000516721 P3H3Q8IVL6 736 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-965P-201ENST00000516721 RASEFQ8IZ41 740 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-965P-201ENST00000516721 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-965P-201ENST00000516721 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-965P-201ENST00000516721 STK24Q9Y6E0 443 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-965P-201ENST00000516721 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-965P-201ENST00000516721 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-965P-201ENST00000516721 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-965P-201ENST00000516721 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-965P-201ENST00000516721 PYGBP11216 843 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-965P-201ENST00000516721 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-965P-201ENST00000516721 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-965P-201ENST00000516721 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-965P-201ENST00000516721 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-965P-201ENST00000516721 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-965P-201ENST00000516721 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-965P-201ENST00000516721 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-965P-201ENST00000516721 WDR70Q9NW82 654 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-965P-201ENST00000516721 CCDC61Q9Y6R9 512 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-965P-201ENST00000516721 SOX12O15370 315 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-965P-201ENST00000516721 PSEN1P49768 467 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-965P-201ENST00000516721 NLRP6P59044 892 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-965P-201ENST00000516721 TPRNQ4KMQ1 711 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-965P-201ENST00000516721 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-965P-201ENST00000516721 CLCN6P51797 869 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-965P-201ENST00000516721 CHADLQ6NUI6 762 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-965P-201ENST00000516721 CHRDL2Q6WN34 429 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-965P-201ENST00000516721 GOLGA2Q08379 1002 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-965P-201ENST00000516721 ERICH6Q7L0X2 663 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-965P-201ENST00000516721 KIF12Q96FN5 646 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-965P-201ENST00000516721 PCDHB8Q9UN66 801 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-965P-201ENST00000516721 PIP4P2Q8N4L2 257 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-965P-201ENST00000516721 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-965P-201ENST00000516721 MFRPQ9BY79 579 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-965P-201ENST00000516721 CD44P16070 742 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-965P-201ENST00000516721 IFNL1Q8IU54 200 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-965P-201ENST00000516721 MAP3K13O43283 966 aa4.73□□□□□ -1.65
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RNU6-965P-201ENST00000516721 PDE4AP27815 886 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-965P-201ENST00000516721 SMYD5Q6GMV2 418 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-965P-201ENST00000516721 CABP2Q9NPB3 220 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-965P-201ENST00000516721 ZRANB1Q9UGI0 708 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-965P-201ENST00000516721 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-965P-201ENST00000516721 FBXO22Q8NEZ5 403 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-965P-201ENST00000516721 E2F4Q16254 413 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-965P-201ENST00000516721 EFCAB3Q8N7B9 438 aa4.71□□□□□ -1.66
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RNU6-965P-201ENST00000516721 TIE1P35590 1138 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-965P-201ENST00000516721 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-965P-201ENST00000516721 KCNV2Q8TDN2 545 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-965P-201ENST00000516721 TMEM106CQ9BVX2 250 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-965P-201ENST00000516721 PHF8Q9UPP1 1060 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-965P-201ENST00000516721 C19orf67A6NJJ6 358 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-965P-201ENST00000516721 MFSD10Q14728 455 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-965P-201ENST00000516721 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-965P-201ENST00000516721 LMOD2Q6P5Q4 547 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-965P-201ENST00000516721 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-965P-201ENST00000516721 CADPS2Q86UW7 1296 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-965P-201ENST00000516721 TMEM132AQ24JP5 1023 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-965P-201ENST00000516721 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-965P-201ENST00000516721 G3V3G9 751 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-965P-201ENST00000516721 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-965P-201ENST00000516721 PHF12Q96QT6 1004 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-965P-201ENST00000516721 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-965P-201ENST00000516721 PPP1R37O75864 691 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-965P-201ENST00000516721 CAMK2BQ13554 666 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-965P-201ENST00000516721 IER5LQ5T953 404 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-965P-201ENST00000516721 MS4A3Q96HJ5 214 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-965P-201ENST00000516721 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-965P-201ENST00000516721 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-965P-201ENST00000516721 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-965P-201ENST00000516721 TTLL13PA6NNM8 815 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-965P-201ENST00000516721 MS4A4AQ96JQ5 239 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-965P-201ENST00000516721 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-965P-201ENST00000516721 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-965P-201ENST00000516721 TMC2Q8TDI7 906 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-965P-201ENST00000516721 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-965P-201ENST00000516721 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-965P-201ENST00000516721 OCEL1Q9H607 264 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-965P-201ENST00000516721 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-965P-201ENST00000516721 TRIM35Q9UPQ4 493 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-965P-201ENST00000516721 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
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