RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496526.5

TTLL3-232, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTLL3, Length 5,282 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-232ENST00000496526 CEP162Q5TB80 1403 aa14.76□□□□□ -0.05
TTLL3-232ENST00000496526 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TTLL3-232ENST00000496526 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
TTLL3-232ENST00000496526 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TTLL3-232ENST00000496526 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TTLL3-232ENST00000496526 C14orf37Q86TY3 774 aa14.72□□□□□ -0.05
TTLL3-232ENST00000496526 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.72□□□□□ -0.05
TTLL3-232ENST00000496526 CDCA8Q53HL2 280 aa14.72□□□□□ -0.05
TTLL3-232ENST00000496526 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TTLL3-232ENST00000496526 MRS2Q9HD23 443 aa14.69□□□□□ -0.06
TTLL3-232ENST00000496526 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TTLL3-232ENST00000496526 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TTLL3-232ENST00000496526 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.66□□□□□ -0.06
TTLL3-232ENST00000496526 RGL3Q3MIN7 710 aa14.64□□□□□ -0.07
TTLL3-232ENST00000496526 FKBP8Q14318 412 aa14.63□□□□□ -0.07
TTLL3-232ENST00000496526 CFAP53Q96M91 514 aa14.63□□□□□ -0.07
TTLL3-232ENST00000496526 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.62□□□□□ -0.07
TTLL3-232ENST00000496526 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.62□□□□□ -0.07
TTLL3-232ENST00000496526 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.62□□□□□ -0.07
TTLL3-232ENST00000496526 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.62□□□□□ -0.07
TTLL3-232ENST00000496526 CUX2O14529 1486 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-232ENST00000496526 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TTLL3-232ENST00000496526 A0A0G2JS52 829 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-232ENST00000496526 ZBTB7CA1YPR0 619 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-232ENST00000496526 CECR2Q9BXF3 1484 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL3-232ENST00000496526 SMARCA2P51531 1590 aa14.59□□□□□ -0.07
TTLL3-232ENST00000496526 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.58□□□□□ -0.07
TTLL3-232ENST00000496526 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TTLL3-232ENST00000496526 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.57□□□□□ -0.08
TTLL3-232ENST00000496526 KANK1Q14678 1352 aa14.57□□□□□ -0.08
TTLL3-232ENST00000496526 HDGFP51858 240 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TTLL3-232ENST00000496526 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TTLL3-232ENST00000496526 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.55□□□□□ -0.08
TTLL3-232ENST00000496526 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.55□□□□□ -0.08
TTLL3-232ENST00000496526 POGKQ9P215 609 aa14.54□□□□□ -0.08
TTLL3-232ENST00000496526 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TTLL3-232ENST00000496526 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
TTLL3-232ENST00000496526 PLEKHG5O94827 1062 aa14.51□□□□□ -0.09
TTLL3-232ENST00000496526 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TTLL3-232ENST00000496526 NUDCQ9Y266 331 aa14.49□□□□□ -0.09
TTLL3-232ENST00000496526 SOGA1O94964 1423 aa14.46□□□□□ -0.09
TTLL3-232ENST00000496526 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.45□□□□□ -0.1
TTLL3-232ENST00000496526 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
TTLL3-232ENST00000496526 CCDC88BA6NC98 1476 aa14.45□□□□□ -0.1
TTLL3-232ENST00000496526 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.42□□□□□ -0.1
TTLL3-232ENST00000496526 MROH2BQ7Z745 1585 aa14.42□□□□□ -0.1
TTLL3-232ENST00000496526 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.42□□□□□ -0.1
TTLL3-232ENST00000496526 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
TTLL3-232ENST00000496526 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.41□□□□□ -0.1
TTLL3-232ENST00000496526 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
TTLL3-232ENST00000496526 FMN1Q68DA7 1419 aa14.4□□□□□ -0.1
TTLL3-232ENST00000496526 TMF1P82094 1093 aa14.4□□□□□ -0.1
TTLL3-232ENST00000496526 MIER1Q8N108 512 aa14.4□□□□□ -0.1
TTLL3-232ENST00000496526 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.4□□□□□ -0.1
TTLL3-232ENST00000496526 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.39□□□□□ -0.11
TTLL3-232ENST00000496526 MLECQ14165 292 aa14.39□□□□□ -0.11
TTLL3-232ENST00000496526 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.38□□□□□ -0.11
TTLL3-232ENST00000496526 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
TTLL3-232ENST00000496526 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
TTLL3-232ENST00000496526 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.36□□□□□ -0.11
TTLL3-232ENST00000496526 ARXQ96QS3 562 aa14.36□□□□□ -0.11
TTLL3-232ENST00000496526 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.36□□□□□ -0.11
TTLL3-232ENST00000496526 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
TTLL3-232ENST00000496526 GGT6Q6P531 493 aa14.35□□□□□ -0.11
TTLL3-232ENST00000496526 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.34□□□□□ -0.11
TTLL3-232ENST00000496526 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
TTLL3-232ENST00000496526 MS4A1P11836 297 aa14.33□□□□□ -0.12
TTLL3-232ENST00000496526 CASC1Q6TDU7 716 aa14.32□□□□□ -0.12
TTLL3-232ENST00000496526 BECN1Q14457 450 aa14.32□□□□□ -0.12
TTLL3-232ENST00000496526 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
TTLL3-232ENST00000496526 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.31□□□□□ -0.12
TTLL3-232ENST00000496526 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.3□□□□□ -0.12
TTLL3-232ENST00000496526 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
TTLL3-232ENST00000496526 NEUROD2Q15784 382 aa14.3□□□□□ -0.12
TTLL3-232ENST00000496526 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.3□□□□□ -0.12
TTLL3-232ENST00000496526 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
TTLL3-232ENST00000496526 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.29□□□□□ -0.12
TTLL3-232ENST00000496526 PKD2Q13563 968 aa14.28□□□□□ -0.12
TTLL3-232ENST00000496526 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
TTLL3-232ENST00000496526 NPHP1O15259 732 aa14.27□□□□□ -0.12
TTLL3-232ENST00000496526 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
TTLL3-232ENST00000496526 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
TTLL3-232ENST00000496526 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
TTLL3-232ENST00000496526 ABCC8Q09428 1581 aa14.26□□□□□ -0.13
TTLL3-232ENST00000496526 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
TTLL3-232ENST00000496526 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
TTLL3-232ENST00000496526 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.26□□□□□ -0.13
TTLL3-232ENST00000496526 MORC1Q86VD1 984 aa14.24□□□□□ -0.13
TTLL3-232ENST00000496526 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa14.24□□□□□ -0.13
TTLL3-232ENST00000496526 GOLGA6L22H0YM25 854 aa14.23□□□□□ -0.13
TTLL3-232ENST00000496526 NUP155O75694 1391 aa14.23□□□□□ -0.13
TTLL3-232ENST00000496526 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.22□□□□□ -0.13
TTLL3-232ENST00000496526 JPH4Q96JJ6 628 aa14.21□□□□□ -0.13
TTLL3-232ENST00000496526 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.21□□□□□ -0.13
TTLL3-232ENST00000496526 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
TTLL3-232ENST00000496526 KIF3BO15066 747 aa14.2□□□□□ -0.14
TTLL3-232ENST00000496526 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
TTLL3-232ENST00000496526 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.19□□□□□ -0.14
TTLL3-232ENST00000496526 STK26Q9P289 416 aa14.19□□□□□ -0.14
TTLL3-232ENST00000496526 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms