RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTC3-222	ENST00000491952	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTC3-222	ENST00000491952	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTC3-222	ENST00000491952	OTUD5	Q96G74	571 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTC3-222	ENST00000491952	PLEKHG5	O94827	1062 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTC3-222	ENST00000491952	FKBP8	Q14318	412 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TTC3-222	ENST00000491952	NUBP1	P53384	320 aa		11.85	□□□□□ -0.51
TTC3-222	ENST00000491952	MAP3K13	O43283	966 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TTC3-222	ENST00000491952	POTEJ	P0CG39	1038 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TTC3-222	ENST00000491952	C7	P10643	843 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TTC3-222	ENST00000491952	SLC39A7	Q92504	469 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TTC3-222	ENST00000491952	TRPC6	Q9Y210	931 aa		11.83	□□□□□ -0.52
TTC3-222	ENST00000491952	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
TTC3-222	ENST00000491952	METRN	Q9UJH8	293 aa		11.82	□□□□□ -0.52
TTC3-222	ENST00000491952	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
TTC3-222	ENST00000491952	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		11.8	□□□□□ -0.52
TTC3-222	ENST00000491952	TIE1	P35590	1138 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTC3-222	ENST00000491952	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTC3-222	ENST00000491952	POTEF	A5A3E0	1075 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTC3-222	ENST00000491952	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TTC3-222	ENST00000491952	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTC3-222	ENST00000491952	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TTC3-222	ENST00000491952	IFNL1	Q8IU54	200 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTC3-222	ENST00000491952	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TTC3-222	ENST00000491952	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTC3-222	ENST00000491952	FAM212A	Q96EL1	285 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTC3-222	ENST00000491952	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTC3-222	ENST00000491952	IER5L	Q5T953	404 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTC3-222	ENST00000491952	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TTC3-222	ENST00000491952	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TTC3-222	ENST00000491952	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	11.55	□□□□□ -0.56
TTC3-222	ENST00000491952	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		11.54	□□□□□ -0.56
TTC3-222	ENST00000491952	POTEM	A6NI47	508 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTC3-222	ENST00000491952	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTC3-222	ENST00000491952	PYGB	P11216	843 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTC3-222	ENST00000491952	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTC3-222	ENST00000491952	POTEG	Q6S5H5	508 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTC3-222	ENST00000491952	SEC24B	O95487	1268 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTC3-222	ENST00000491952	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTC3-222	ENST00000491952	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTC3-222	ENST00000491952	GSE1	Q14687	1217 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTC3-222	ENST00000491952	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TTC3-222	ENST00000491952	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TTC3-222	ENST00000491952	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TTC3-222	ENST00000491952	OCEL1	Q9H607	264 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TTC3-222	ENST00000491952	PLCG2	P16885	1265 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTC3-222	ENST00000491952	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TTC3-222	ENST00000491952	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTC3-222	ENST00000491952	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTC3-222	ENST00000491952	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
TTC3-222	ENST00000491952	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTC3-222	ENST00000491952	SPOCK2	Q92563	424 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTC3-222	ENST00000491952	PSEN1	P49768	467 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTC3-222	ENST00000491952	ST18	O60284	1047 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTC3-222	ENST00000491952	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TTC3-222	ENST00000491952	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTC3-222	ENST00000491952	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTC3-222	ENST00000491952	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTC3-222	ENST00000491952	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTC3-222	ENST00000491952	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62	2e-7	■■■□□ 18.2
TTC3-222	ENST00000491952	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TTC3-222	ENST00000491952	GOLGA2	Q08379	1002 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTC3-222	ENST00000491952	TRIM41	Q8WV44	630 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTC3-222	ENST00000491952	SNPH	O15079	494 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTC3-222	ENST00000491952	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTC3-222	ENST00000491952	CABP2	Q9NPB3	220 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTC3-222	ENST00000491952	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTC3-222	ENST00000491952	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
TTC3-222	ENST00000491952	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTC3-222	ENST00000491952	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		10.99	□□□□□ -0.65
TTC3-222	ENST00000491952	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
TTC3-222	ENST00000491952	MARVELD3	Q96A59	401 aa		10.98	□□□□□ -0.65
TTC3-222	ENST00000491952	POTEB3	A0JP26	581 aa		10.96	□□□□□ -0.65
TTC3-222	ENST00000491952	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
TTC3-222	ENST00000491952	POTEB	Q6S5H4	581 aa		10.96	□□□□□ -0.65
TTC3-222	ENST00000491952	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		10.93	□□□□□ -0.66
TTC3-222	ENST00000491952	SOX12	O15370	315 aa		10.92	□□□□□ -0.66
TTC3-222	ENST00000491952	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	10.91	□□□□□ -0.66
TTC3-222	ENST00000491952	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	10.91	□□□□□ -0.66
TTC3-222	ENST00000491952	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	10.91	□□□□□ -0.66
TTC3-222	ENST00000491952	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		10.9	□□□□□ -0.66
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		10.89	□□□□□ -0.67
TTC3-222	ENST00000491952	EMP3	P54852	163 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTC3-222	ENST00000491952	MICALL2	Q8IY33	904 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TTC3-222	ENST00000491952	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTC3-222	ENST00000491952	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTC3-222	ENST00000491952	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTC3-222	ENST00000491952		G3V3G9	751 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTC3-222	ENST00000491952	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TTC3-222	ENST00000491952	MMRN1	Q13201	1228 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTC3-222	ENST00000491952	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTC3-222	ENST00000491952	FAM205C	A6NFA0	338 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTC3-222	ENST00000491952	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTC3-222	ENST00000491952	DOK7	Q18PE1	504 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TTC3-222	ENST00000491952	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TTC3-222	ENST00000491952	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
TTC3-222	ENST00000491952	NLRP6	P59044	892 aa		10.75	□□□□□ -0.69

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