RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410554.1

RNU6-77P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 77, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-77P, Length 91 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-77P-201ENST00000410554 HS6ST3Q8IZP7 471 aa10.13□□□□□ -0.79
RNU6-77P-201ENST00000410554 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RNU6-77P-201ENST00000410554 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa10.12□□□□□ -0.79
RNU6-77P-201ENST00000410554 CREBZFQ9NS37 354 aa10.12□□□□□ -0.79
RNU6-77P-201ENST00000410554 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RNU6-77P-201ENST00000410554 FAM212AQ96EL1 285 aa10.09□□□□□ -0.79
RNU6-77P-201ENST00000410554 TAOK2Q9UL54 1235 aa10.08□□□□□ -0.8
RNU6-77P-201ENST00000410554 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RNU6-77P-201ENST00000410554 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RNU6-77P-201ENST00000410554 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.05□□□□□ -0.8
RNU6-77P-201ENST00000410554 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RNU6-77P-201ENST00000410554 RASEFQ8IZ41 740 aa10.01□□□□□ -0.81
RNU6-77P-201ENST00000410554 VGFO15240 615 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RNU6-77P-201ENST00000410554 STK25O00506 426 aa9.99□□□□□ -0.81
RNU6-77P-201ENST00000410554 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RNU6-77P-201ENST00000410554 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RNU6-77P-201ENST00000410554 PITPNM1O00562 1244 aa9.97□□□□□ -0.81
RNU6-77P-201ENST00000410554 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.95□□□□□ -0.82
RNU6-77P-201ENST00000410554 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
RNU6-77P-201ENST00000410554 PYGBP11216 843 aa9.94□□□□□ -0.82
RNU6-77P-201ENST00000410554 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RNU6-77P-201ENST00000410554 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RNU6-77P-201ENST00000410554 SGIP1Q9BQI5 828 aa9.92□□□□□ -0.82
RNU6-77P-201ENST00000410554 STK24Q9Y6E0 443 aa9.92□□□□□ -0.82
RNU6-77P-201ENST00000410554 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RNU6-77P-201ENST00000410554 NBR1Q14596 966 aa9.89□□□□□ -0.83
RNU6-77P-201ENST00000410554 CHADLQ6NUI6 762 aa9.87□□□□□ -0.83
RNU6-77P-201ENST00000410554 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
RNU6-77P-201ENST00000410554 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
RNU6-77P-201ENST00000410554 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
RNU6-77P-201ENST00000410554 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RNU6-77P-201ENST00000410554 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
RNU6-77P-201ENST00000410554 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
RNU6-77P-201ENST00000410554 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.74□□□□□ -0.85
RNU6-77P-201ENST00000410554 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.74□□□□□ -0.85
RNU6-77P-201ENST00000410554 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.72□□□□□ -0.85
RNU6-77P-201ENST00000410554 PSEN1P49768 467 aa9.69□□□□□ -0.86
RNU6-77P-201ENST00000410554 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
RNU6-77P-201ENST00000410554 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.68□□□□□ -0.86
RNU6-77P-201ENST00000410554 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
RNU6-77P-201ENST00000410554 P3H3Q8IVL6 736 aa9.67□□□□□ -0.86
RNU6-77P-201ENST00000410554 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.65□□□□□ -0.86
RNU6-77P-201ENST00000410554 WDR70Q9NW82 654 aa9.65□□□□□ -0.86
RNU6-77P-201ENST00000410554 MFRPQ9BY79 579 aa9.64□□□□□ -0.87
RNU6-77P-201ENST00000410554 IFNL1Q8IU54 200 aa9.62□□□□□ -0.87
RNU6-77P-201ENST00000410554 MAP3K13O43283 966 aa9.6□□□□□ -0.87
RNU6-77P-201ENST00000410554 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.59□□□□□ -0.87
RNU6-77P-201ENST00000410554 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.58□□□□□ -0.88
RNU6-77P-201ENST00000410554 KIF12Q96FN5 646 aa9.58□□□□□ -0.88
RNU6-77P-201ENST00000410554 CABP2Q9NPB3 220 aa9.58□□□□□ -0.88
RNU6-77P-201ENST00000410554 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.57□□□□□ -0.88
RNU6-77P-201ENST00000410554 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.57□□□□□ -0.88
RNU6-77P-201ENST00000410554 NLRP6P59044 892 aa9.56□□□□□ -0.88
RNU6-77P-201ENST00000410554 PPP1R37O75864 691 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU6-77P-201ENST00000410554 SOX12O15370 315 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-77P-201ENST00000410554 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-77P-201ENST00000410554 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-77P-201ENST00000410554 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.53□□□□□ -0.88
RNU6-77P-201ENST00000410554 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RNU6-77P-201ENST00000410554 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.47□□□□□ -0.89
RNU6-77P-201ENST00000410554 PHF12Q96QT6 1004 aa9.47□□□□□ -0.89
RNU6-77P-201ENST00000410554 E2F4Q16254 413 aa9.46□□□□□ -0.9
RNU6-77P-201ENST00000410554 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
RNU6-77P-201ENST00000410554 GOLGA2Q08379 1002 aa9.45□□□□□ -0.9
RNU6-77P-201ENST00000410554 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RNU6-77P-201ENST00000410554 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RNU6-77P-201ENST00000410554 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.42□□□□□ -0.9
RNU6-77P-201ENST00000410554 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.42□□□□□ -0.9
RNU6-77P-201ENST00000410554 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.41□□□□□ -0.9
RNU6-77P-201ENST00000410554 PDE4AP27815 886 aa9.4□□□□□ -0.9
RNU6-77P-201ENST00000410554 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RNU6-77P-201ENST00000410554 MS4A3Q96HJ5 214 aa9.38□□□□□ -0.91
RNU6-77P-201ENST00000410554 TRPC6Q9Y210 931 aa9.38□□□□□ -0.91
RNU6-77P-201ENST00000410554 SEMA3EO15041 775 aa9.37□□□□□ -0.91
RNU6-77P-201ENST00000410554 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
RNU6-77P-201ENST00000410554 MFSD10Q14728 455 aa9.36□□□□□ -0.91
RNU6-77P-201ENST00000410554 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.36□□□□□ -0.91
RNU6-77P-201ENST00000410554 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
RNU6-77P-201ENST00000410554 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
RNU6-77P-201ENST00000410554 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.33□□□□□ -0.92
RNU6-77P-201ENST00000410554 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.32□□□□□ -0.92
RNU6-77P-201ENST00000410554 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
RNU6-77P-201ENST00000410554 TIE1P35590 1138 aa9.31□□□□□ -0.92
RNU6-77P-201ENST00000410554 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.31□□□□□ -0.92
RNU6-77P-201ENST00000410554 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.29□□□□□ -0.92
RNU6-77P-201ENST00000410554 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.29□□□□□ -0.92
RNU6-77P-201ENST00000410554 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
RNU6-77P-201ENST00000410554 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
RNU6-77P-201ENST00000410554 CAMK2BQ13554 666 aa9.27□□□□□ -0.93
RNU6-77P-201ENST00000410554 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RNU6-77P-201ENST00000410554 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RNU6-77P-201ENST00000410554 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.25□□□□□ -0.93
RNU6-77P-201ENST00000410554 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
RNU6-77P-201ENST00000410554 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa9.24□□□□□ -0.93
RNU6-77P-201ENST00000410554 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.24□□□□□ -0.93
RNU6-77P-201ENST00000410554 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.24□□□□□ -0.93
RNU6-77P-201ENST00000410554 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
RNU6-77P-201ENST00000410554 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
RNU6-77P-201ENST00000410554 ZMYND10O75800 440 aa9.2□□□□□ -0.94
RNU6-77P-201ENST00000410554 NEUROD2Q15784 382 aa9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms