RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-655P-201ENST00000362858 BCANQ96GW7 911 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRR29P0C7W0 189 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-655P-201ENST00000362858 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-655P-201ENST00000362858 CLEC11AQ9Y240 323 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-655P-201ENST00000362858 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-655P-201ENST00000362858 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-655P-201ENST00000362858 DCAF8Q5TAQ9 597 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM212AQ96EL1 285 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-655P-201ENST00000362858 PITPNM1O00562 1244 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-655P-201ENST00000362858 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU6-655P-201ENST00000362858 RASEFQ8IZ41 740 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-655P-201ENST00000362858 TAOK2Q9UL54 1235 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-655P-201ENST00000362858 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RNU6-655P-201ENST00000362858 VGFO15240 615 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-655P-201ENST00000362858 SGIP1Q9BQI5 828 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-655P-201ENST00000362858 STK25O00506 426 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 PYGBP11216 843 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 STK24Q9Y6E0 443 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 CHADLQ6NUI6 762 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 TPRNQ4KMQ1 711 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 NBR1Q14596 966 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP5.47□□□□□ -1.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCDC61Q9Y6R9 512 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 PCDHB8Q9UN66 801 aa5.45□□□□□ -1.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa5.45□□□□□ -1.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 PSEN1P49768 467 aa5.43□□□□□ -1.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 CADPS2Q86UW7 1296 aa5.41□□□□□ -1.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 IFNL1Q8IU54 200 aa5.41□□□□□ -1.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 MFRPQ9BY79 579 aa5.41□□□□□ -1.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 CHRDL2Q6WN34 429 aa5.4□□□□□ -1.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 PIP4P2Q8N4L2 257 aa5.4□□□□□ -1.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 KIF12Q96FN5 646 aa5.4□□□□□ -1.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAP3K13O43283 966 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 P3H3Q8IVL6 736 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 FBXO22Q8NEZ5 403 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPP1R37O75864 691 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 EFCAB3Q8N7B9 438 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCNV2Q8TDN2 545 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 SOX12O15370 315 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 NLRP6P59044 892 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 CABP2Q9NPB3 220 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 WDR70Q9NW82 654 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZRANB1Q9UGI0 708 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 PHF8Q9UPP1 1060 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 CD44P16070 742 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
RNU6-655P-201ENST00000362858 PHF12Q96QT6 1004 aa5.33□□□□□ -1.56
RNU6-655P-201ENST00000362858 MS4A4AQ96JQ5 239 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-655P-201ENST00000362858 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-655P-201ENST00000362858 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-655P-201ENST00000362858 E2F4Q16254 413 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-655P-201ENST00000362858 LMOD2Q6P5Q4 547 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-655P-201ENST00000362858 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP5.28□□□□□ -1.56
RNU6-655P-201ENST00000362858 MS4A3Q96HJ5 214 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM106CQ9BVX2 250 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-655P-201ENST00000362858 C19orf67A6NJJ6 358 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-655P-201ENST00000362858 MFSD10Q14728 455 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRPC6Q9Y210 931 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-655P-201ENST00000362858 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa5.26□□□□□ -1.57
RNU6-655P-201ENST00000362858 GOLGA2Q08379 1002 aa5.25□□□□□ -1.57
RNU6-655P-201ENST00000362858 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RNU6-655P-201ENST00000362858 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
RNU6-655P-201ENST00000362858 PDE4AP27815 886 aa5.24□□□□□ -1.57
RNU6-655P-201ENST00000362858 TIE1P35590 1138 aa5.24□□□□□ -1.57
RNU6-655P-201ENST00000362858 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
RNU6-655P-201ENST00000362858 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
RNU6-655P-201ENST00000362858 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
RNU6-655P-201ENST00000362858 TTLL13PA6NNM8 815 aa5.23□□□□□ -1.57
RNU6-655P-201ENST00000362858 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
RNU6-655P-201ENST00000362858 SEMA3EO15041 775 aa5.23□□□□□ -1.57
RNU6-655P-201ENST00000362858 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
RNU6-655P-201ENST00000362858 CAMK2BQ13554 666 aa5.22□□□□□ -1.57
RNU6-655P-201ENST00000362858 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RNU6-655P-201ENST00000362858 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
RNU6-655P-201ENST00000362858 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.58
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM132AQ24JP5 1023 aa5.18□□□□□ -1.58
RNU6-655P-201ENST00000362858 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRIM35Q9UPQ4 493 aa5.18□□□□□ -1.58
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa5.17□□□□□ -1.58
RNU6-655P-201ENST00000362858 SMYD5Q6GMV2 418 aa5.17□□□□□ -1.58
RNU6-655P-201ENST00000362858 MICALL2Q8IY33 904 aa5.16□□□□□ -1.58
RNU6-655P-201ENST00000362858 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZMYND10O75800 440 aa5.15□□□□□ -1.59
RNU6-655P-201ENST00000362858 CLCN6P51797 869 aa5.15□□□□□ -1.59
RNU6-655P-201ENST00000362858 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
RNU6-655P-201ENST00000362858 DPY19L2Q6NUT2 758 aa5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms