RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 Q5BKY6 102 aa5.73□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa5.73□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 EPDR1Q9UM22 224 aa5.73□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.72□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 SH2D1AO60880 128 aa5.72□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 BCL2P10415 239 aa5.72□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 CAMPP49913 170 aa5.72□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF345Q14585 488 aa5.72□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 FAM162BQ5T6X4 162 aa5.72□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.72□□□□□ -1.49
SMAD3-211ENST00000559460 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.72□□□□□ -1.49
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SMAD3-211ENST00000559460 UBE2BP63146 152 aa5.71□□□□□ -1.5
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SMAD3-211ENST00000559460 COTL1Q14019 142 aa5.7□□□□□ -1.5
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SMAD3-211ENST00000559460 AP1S3Q96PC3 154 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD3-211ENST00000559460 TNFSF18Q9UNG2 199 aa5.7□□□□□ -1.5
SMAD3-211ENST00000559460 HSPB11Q9Y547 144 aa5.7□□□□□ -1.5
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SMAD3-211ENST00000559460 SSTP61278 116 aa5.69□□□□□ -1.5
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SMAD3-211ENST00000559460 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.69□□□□□ -1.5
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SMAD3-211ENST00000559460 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.69□□□□□ -1.5
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SMAD3-211ENST00000559460 UBE2G1P62253 170 aa5.68□□□□□ -1.5
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SMAD3-211ENST00000559460 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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SMAD3-211ENST00000559460 ARPC5O15511 151 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD3-211ENST00000559460 MALP21145 153 aa5.67□□□□□ -1.5
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SMAD3-211ENST00000559460 TMUB2Q71RG4 321 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD3-211ENST00000559460 C9orf62Q8N4C0 152 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD3-211ENST00000559460 OR5A1Q8NGJ0 315 aa5.67□□□□□ -1.5
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SMAD3-211ENST00000559460 ZFP30Q9Y2G7 519 aa5.67□□□□□ -1.5
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SMAD3-211ENST00000559460 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SMAD3-211ENST00000559460 PEX7O00628 323 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD3-211ENST00000559460 BCL2L11O43521 198 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD3-211ENST00000559460 STAG3L2P0CL84 134 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD3-211ENST00000559460 STAG3L3P0CL85 134 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD3-211ENST00000559460 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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SMAD3-211ENST00000559460 STOML3Q8TAV4 291 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM101Q96IK0 257 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD3-211ENST00000559460 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SMAD3-211ENST00000559460 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.64□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 M0QY20 66 aa5.64□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 CXorf1O96002 111 aa5.64□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.64□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 FMC1Q96HJ9 113 aa5.64□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1W2PRE2 83 aa5.63□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 M0QXV9 152 aa5.63□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF861PO60384 105 aa5.63□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 ATP6V0CP27449 155 aa5.63□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.63□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.63□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 HIST1H2BAQ96A08 127 aa5.63□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 NIT2Q9NQR4 276 aa5.63□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 A0A087X002 238 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 H7C423 109 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 SNAI2O43623 268 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 TSHBP01222 138 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 CXCL1P09341 107 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 OR5AL1P0C617 328 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 SERF2P84101 59 aa5.62□□□□□ -1.51
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