RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 DAND5Q8N907 189 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 IGIPA6NJ69 53 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 FAM236CP0DP71 79 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 I3L3M4 83 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 LEPROTO15243 131 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 ATP6V0E1O15342 81 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 AVPP01185 164 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 FHL2Q14192 279 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 CTSGP08311 255 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 C15orf32Q32M92 178 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 CENPEQ02224 2701 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 G3V318 75 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 NDUFC2O95298 119 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 NPC2P61916 151 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF876PQ49A33 203 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 LITAFQ99732 161 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 C1orf195Q5TG92 126 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 BUB3O43684 328 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 SYNJ2BPP57105 145 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 A0A0J9YXY3 114 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 CCL19Q99731 98 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-209ENST00000519674 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM141Q96I45 108 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 TIMM17AQ99595 171 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 M0R381 172 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 PRSS2P07478 247 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 TIRAPP58753 221 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 C22orf24Q9Y442 160 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 CUBNO60494 3623 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 NACAE9PAV3 2078 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 USP17L23D6RBM5 183 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 POLQO75417 2590 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 LRRK2Q5S007 2527 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 Q6ZSV7 163 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC140Q96MF4 163 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 USP24Q9UPU5 2620 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 Q6JHZ5 121 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 C16orf92Q96LL3 132 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 ZANQ9Y493 2812 aa6.24□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.24□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV1-69P01742 117 aa6.24□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.24□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 GPHB5Q86YW7 130 aa6.24□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.24□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 LY6EQ16553 131 aa6.23□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.23□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.23□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 A0A087WVE0 104 aa6.23□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 FAM223BA6NKX1 122 aa6.23□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 PPP1R17O96001 155 aa6.23□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 MIAQ16674 131 aa6.23□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.23□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 RNF182Q8N6D2 247 aa6.23□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.23□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.23□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 COX7A2LO14548 114 aa6.23□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM243Q9BU79 118 aa6.23□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 PRAC2D3DTV9 90 aa6.22□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.22□□□□□ -1.41
TRPS1-209ENST00000519674 FBN2P35556 2912 aa6.22□□□□□ -1.41
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