RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 PRO0461Q9UI25 63 aa5.21□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.21□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 C9JAW5 83 aa5.21□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 K7EMT4 169 aa5.21□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 CD7P09564 240 aa5.21□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 HTN1P15515 57 aa5.21□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.21□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 TEN1Q86WV5 123 aa5.21□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.21□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 HIVEP1P15822 2718 aa5.21□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 SLURP1P55000 103 aa5.2□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 SPINK13Q1W4C9 94 aa5.2□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 LGALS9BQ3B8N2 356 aa5.2□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 C2CD3Q4AC94 2353 aa5.2□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 LGALS9CQ6DKI2 356 aa5.2□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 Q8N8P6 123 aa5.2□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 A0A087WWL8 130 aa5.2□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 CFAP126Q5VTH2 177 aa5.2□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.19□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 F5H697 171 aa5.19□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 J3KT08 172 aa5.19□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.19□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 CARD19Q96LW7 228 aa5.19□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 NACAE9PAV3 2078 aa5.19□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 LAGE3Q14657 143 aa5.19□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.19□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 RASL10AQ92737 203 aa5.19□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.19□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 FASNP49327 2511 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 HECTD1Q9ULT8 2610 aa5.19□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa5.19□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.19□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 FAM19A4Q96LR4 140 aa5.19□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 ELANEP08246 267 aa5.18□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.18□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.18□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 MDFICQ9P1T7 246 aa5.18□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 LINC01549A6NIU2 74 aa5.18□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 KNCNA6PVL3 124 aa5.18□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 KLLNB2CW77 178 aa5.18□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 K7EQG2 157 aa5.18□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.18□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.18□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.18□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.18□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 LYSTQ99698 3801 aa5.18□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 A0A0J9YX75 114 aa5.18□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 PRM2P04554 102 aa5.18□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.18□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PRX2 142 aa5.17□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.17□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 HIGD1BQ9P298 99 aa5.17□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.17□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 DEFB131AP59861 70 aa5.17□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZSV7 163 aa5.17□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 Q8N1Y9 231 aa5.17□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 LINC01006Q8NI28 216 aa5.17□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.17□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 FN1P02751 2386 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.16□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 IGKCP01834 107 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 APRG1Q8IVJ8 170 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 ATP5LO75964 103 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 HERVK_113P63121 156 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 TMEM101Q96IK0 257 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 HIVEP2P31629 2446 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 LINC01546A6NGU7 62 aa5.15□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 DPM2O94777 84 aa5.15□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 ZNF56Q15929 161 aa5.15□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.15□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.15□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 TMEM61Q8N0U2 210 aa5.15□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 B9D2Q9BPU9 175 aa5.15□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
HERC4-211ENST00000492996 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 H7C2G1 150 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 LGALS9O00182 355 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 LINC00315P59091 139 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC4-211ENST00000492996 LINC01619G3V211 115 aa5.14□□□□□ -1.59
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