RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486003.1

AIFM3-216, Transcript of apoptosis inducing factor, mitochondria associated 3, human

TSL 2

Gene AIFM3, Length 2,850 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AIFM3-216	ENST00000486003	AVP	P01185	164 aa		10.21	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	CD164	Q04900	197 aa		10.21	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		10.21	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	RNF223	E7ERA6	249 aa		10.2	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	PMVK	Q15126	192 aa		10.2	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		10.2	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	IGHG2	P01859	326 aa		10.2	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	HTN1	P15515	57 aa		10.2	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	ZNF56	Q15929	161 aa		10.2	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		10.19	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		10.19	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	PPP1R17	O96001	155 aa		10.19	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	CCL19	Q99731	98 aa		10.19	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	PSMB2	P49721	201 aa		10.19	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		10.19	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		10.18	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		10.18	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	UQCRQ	O14949	82 aa		10.18	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	HERVK_113	P61574	105 aa		10.18	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		10.18	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	TSHB	P01222	138 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003		Q9UF83	564 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	VCY	O14598	125 aa		10.16	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		10.16	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003		A6NDX4	124 aa		10.16	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	MED14OS	P0DP75	135 aa		10.16	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	LINC00315	P59091	139 aa		10.16	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		10.15	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		10.15	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		10.15	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	POLQ	O75417	2590 aa		10.15	□□□□□ -0.78
AIFM3-216	ENST00000486003	hADV29S1	A0JD25	119 aa		10.15	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	KLLN	B2CW77	178 aa		10.15	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		10.15	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	CENPE	Q02224	2701 aa		10.15	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003		M0R2P5	195 aa		10.14	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	TEN1	Q86WV5	123 aa		10.14	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	IGIP	A6NJ69	53 aa		10.14	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003		H7C2G1	150 aa		10.14	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	MSMB	P08118	114 aa		10.14	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	DCANP1	Q8TF63	244 aa		10.14	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	CUBN	O60494	3623 aa		10.13	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		10.13	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		10.13	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	COX6B1	P14854	86 aa		10.13	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		10.13	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003		Q8N1Y9	231 aa		10.13	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		10.13	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003		H3BUA1	57 aa		10.13	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	TRAC	P01848	142 aa		10.13	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		10.13	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		10.13	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	IGHV4-59	P01825	116 aa		10.12	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003		A0A087WW49	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003		A0A0J9YY99	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	CCL24	O00175	119 aa		10.12	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	SYNJ2BP	P57105	145 aa		10.12	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		10.12	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		10.12	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		10.12	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	IGLV1-40	P01703	118 aa		10.12	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	SPANXC	Q9NY87	97 aa		10.12	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	ZAN	Q9Y493	2812 aa		10.11	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	ZNF876P	Q49A33	203 aa		10.11	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		10.11	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	LINC01619	G3V211	115 aa		10.11	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		10.11	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	LRRK2	Q5S007	2527 aa		10.1	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	NXPH4	O95158	308 aa		10.1	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	TMEM141	Q96I45	108 aa		10.1	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		10.1	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	ZNF843	Q8N446	348 aa		10.1	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		10.09	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	UBE2D1	P51668	147 aa		10.09	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		10.09	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	TIMM17A	Q99595	171 aa		10.09	□□□□□ -0.79
AIFM3-216	ENST00000486003	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		10.08	□□□□□ -0.8
AIFM3-216	ENST00000486003	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		10.08	□□□□□ -0.8
AIFM3-216	ENST00000486003	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
AIFM3-216	ENST00000486003		A0A0J9YX75	114 aa		10.08	□□□□□ -0.8
AIFM3-216	ENST00000486003		M0QY20	66 aa		10.08	□□□□□ -0.8
AIFM3-216	ENST00000486003	PRM2	P04554	102 aa		10.08	□□□□□ -0.8

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