RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 PKIAP61925 76 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 MIAQ16674 131 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 WDR73Q6P4I2 378 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 Q6ZSA8 131 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.03□□□□□ -0.96
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PRAME-209ENST00000439106 TMEM243Q9BU79 118 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-209ENST00000439106 PRR34Q9NV39 138 aa9.03□□□□□ -0.96
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PRAME-209ENST00000439106 C14orf177Q52M58 125 aa8.98□□□□□ -0.97
PRAME-209ENST00000439106 CT83Q5H943 113 aa8.98□□□□□ -0.97
PRAME-209ENST00000439106 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
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PRAME-209ENST00000439106 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
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PRAME-209ENST00000439106 OSTCQ9NRP0 149 aa8.96□□□□□ -0.98
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PRAME-209ENST00000439106 ISOC2Q96AB3 205 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 RNF185Q96GF1 192 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.95□□□□□ -0.98
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PRAME-209ENST00000439106 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.92□□□□□ -0.98
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PRAME-209ENST00000439106 FAM231BA6NCW3 169 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 I3L3M4 83 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 FGF6P10767 208 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 RAB4AP20338 218 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 PMCHP20382 165 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 PEA15Q15121 130 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 ST20Q9HBF5 79 aa8.92□□□□□ -0.98
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PRAME-209ENST00000439106 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 TSHBP01222 138 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 NDUFA5Q16718 116 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 UQCC3Q6UW78 93 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 NAT8Q9UHE5 227 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 SLPIP03973 132 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 C15orf56Q8N910 161 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PRAME-209ENST00000439106 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.9□□□□□ -0.98
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PRAME-209ENST00000439106 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.89□□□□□ -0.99
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PRAME-209ENST00000439106 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.89□□□□□ -0.99
PRAME-209ENST00000439106 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.89□□□□□ -0.99
PRAME-209ENST00000439106 ESDP10768 282 aa8.88□□□□□ -0.99
PRAME-209ENST00000439106 CAMPP49913 170 aa8.88□□□□□ -0.99
PRAME-209ENST00000439106 MRAP2Q96G30 205 aa8.88□□□□□ -0.99
PRAME-209ENST00000439106 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.87□□□□□ -0.99
PRAME-209ENST00000439106 H7C423 109 aa8.87□□□□□ -0.99
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