RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A087WWL8 130 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 I3L3M4 83 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMAGPQ0VAQ4 97 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 AMTNQ6UX39 209 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 GTSCR1Q86UQ5 136 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 STHQ8IWL8 128 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 WFDC9Q8NEX5 89 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 HHLA3Q9XRX5 114 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 STAB2Q8WWQ8 2551 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 AGRNO00468 2067 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 E9PLD3 99 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 H3BMM0 161 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 TAX1BP3O14907 124 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 GCSHP23434 173 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 FHL3Q13643 280 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCP2Q8IVA1 136 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAJC30Q96LL9 226 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 C9orf118A6NHY6 69 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 C11orf86A6NJI1 115 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 KNCNA6PVL3 124 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 M0QY20 66 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMIM13P0DJ93 91 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 CD28P10747 220 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 FABP2P12104 132 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 CRYBA4P53673 196 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 TCTAP57738 103 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 LINC00315P59091 139 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 DEFB114Q30KQ6 69 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 LYRM7Q5U5X0 104 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 NDUFA11Q86Y39 141 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 CEND1Q8N111 149 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 MUC7Q8TAX7 377 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 LINC01587Q99440 93 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 HIST1H4GQ99525 98 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 MDFICQ9P1T7 246 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 SELENOKQ9Y6D0 94 aa4.62□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 GAGE10A6NGK3 116 aa4.61□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRSS29PA6NIE9 313 aa4.61□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCL24O00175 119 aa4.61□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 CRYGDP07320 174 aa4.61□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa4.61□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.61□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF815PA8K554 130 aa4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 H3BS24 57 aa4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 CIDEAO60543 219 aa4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 HTN1P15515 57 aa4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRADC1Q9BSG0 188 aa4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 TM2D2Q9BX73 214 aa4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPANXA1Q9NS26 97 aa4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 NACAE9PAV3 2078 aa4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 RYR1P21817 5038 aa4.6□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGIPA6NJ69 53 aa4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 H3BUT2 72 aa4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 K7EP34 96 aa4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPRY2O43597 315 aa4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 COTL1Q14019 142 aa4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM170BQ5T4T1 132 aa4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 NFE4Q86UQ8 179 aa4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 VCX2Q9H322 139 aa4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 CST9LQ9H4G1 147 aa4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 JPT2Q9H910 190 aa4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 STARD9Q9P2P6 4700 aa4.59□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1W2PPM0 123 aa4.58□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1W2PRX2 142 aa4.58□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM238C9JI98 176 aa4.58□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 K7EP13 123 aa4.58□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 K7ERU9 68 aa4.58□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCL25O15444 150 aa4.58□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 SAP30O75446 220 aa4.58□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 TSHBP01222 138 aa4.58□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SHQ1P1-201ENST00000437111 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.58□□□□□ -1.68
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