RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-216ENST00000428482 KRTAP10-2P60368 255 aa6.95□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 MYCBP2O75592 4640 aa6.95□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 A0A087WWL8 130 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 LINC01546A6NGU7 62 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 SIVA1O15304 175 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 CKS2P33552 79 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 C20orf78Q9BR46 151 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 GAGE12JA6NER3 117 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 K7EMI3 77 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 SSTP61278 116 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 GAGE1Q13065 139 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 GAGE4Q13068 117 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 GAGE5Q13069 117 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 RHOHQ15669 191 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 GAGE13Q4V321 117 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 TTC32Q5I0X7 151 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 PRELID3AQ96N28 172 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 D6R8Y8 96 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 H7C1H1 209 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 M0QY20 66 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 TNFRSF6BO95407 300 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 S100A6P06703 90 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 NRACQ8N912 160 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00614P0C842 121 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 PMCHP20382 165 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 NDUFA6P56556 154 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 NIT2Q9NQR4 276 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 C16orf90A8MZG2 172 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 IGHV3-30P01768 117 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 IGHV3-33P01772 117 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 NIT1Q86X76 327 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-216ENST00000428482 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 VCYO14598 125 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 TCAPO15273 167 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 NPYP01303 97 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 BAGE3Q86Y29 109 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 Q8N8P6 123 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 LINC01549A6NIU2 74 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 F5H697 171 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 GAS8-AS1O95177 125 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 G0S2P27469 103 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00310P59036 64 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 WFDC2Q14508 124 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 Q9HAA7 133 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.87□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 NUPR1O60356 82 aa6.87□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 MGPP08493 103 aa6.87□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 S100A12P80511 92 aa6.87□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF56Q15929 161 aa6.87□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.87□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 ST20Q9HBF5 79 aa6.87□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 SMKR1H3BMG3 65 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 SERF1AO75920 110 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 HAMPP81172 84 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 LELP1Q5T871 98 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 HERC1Q15751 4861 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 NCR2O95944 276 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 TIRAPP58753 221 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 CTAG1AP78358 180 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 IQCJQ1A5X6 159 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM18Q96B42 140 aa6.85□□□□□ -1.31
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