RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM223A0PJW6 202 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 TCL1BO95988 128 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0J9YXV3 536 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 J3QLI3 93 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 C10orf126Q8N4M7 172 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 VPREB3Q9UKI3 123 aa13.73□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 FN1P02751 2386 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 RBMY1CP0DJD4 496 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 LEPROTO15243 131 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 LYRM7Q5U5X0 104 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 C18orf65Q6ZTR6 163 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 C11orf44Q8N8P7 122 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 VCX2Q9H322 139 aa13.72□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 KNCNA6PVL3 124 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 RHODO00212 210 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 FSHBP01225 129 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 PROK1P58294 105 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 PRO1854Q9UHT4 67 aa13.71□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 PRM2P04554 102 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 SCGB1C2P0DMR2 95 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 JMJD1CQ15652 2540 aa13.71□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 TRGV11A0A075B6L2 103 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAV2A0A0B4J234 112 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 A4D1N5 150 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFB136Q30KP8 78 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6YL49 198 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 DUX3Q96PT4 197 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM89A2RUT3 159 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 RAX2Q96IS3 184 aa13.7□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 HIVEP1P15822 2718 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 SCGB1A1P11684 91 aa13.69□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF702PQ9H963 129 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 H7C2G1 150 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 SPXQ9BT56 116 aa13.68□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 CD28P10747 220 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFB131AP59861 70 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 MUSTN1Q8IVN3 82 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 YAE1D1Q9NRH1 226 aa13.67□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 Q9UF83 564 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 ELANEP08246 267 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 SLURP1P55000 103 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 CARD19Q96LW7 228 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 TEN1Q86WV5 123 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2E2Q96LR5 201 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP1-1Q07627 177 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 A8MWV9 139 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV3-33P01772 117 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 FHL3Q13643 280 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM104AQ969W3 186 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 CDIP1Q9H305 208 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ESM1Q9NQ30 184 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0J9YXY3 114 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 PPDPFLQ8WWR9 84 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF152Q8N8N0 203 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 TIMM21Q9BVV7 248 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ERG28Q9UKR5 140 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZSN1 163 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 M0R2P5 195 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 Q1RN00 199 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 H3BMM0 161 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD29Q8N6D5 301 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 SBSPONQ8IVN8 264 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0B4J2C4 111 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PRX2 142 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 C9JAW5 83 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 A8MZ25 164 aa13.58□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 PRSS2P07478 247 aa13.58□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM61Q8N0U2 210 aa13.58□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 EDA2RQ9HAV5 297 aa13.58□□□□□ -0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 TENM1Q9UKZ4 2725 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A20O43772 301 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 VWFP04275 2813 aa13.58□□□□□ -0.24
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