RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3G-201ENST00000407997 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3G-201ENST00000407997 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3G-201ENST00000407997 TOMM6Q96B49 74 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3G-201ENST00000407997 CARD19Q96LW7 228 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.4□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.4□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.4□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A1W2PRX2 142 aa7.4□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 CD7P09564 240 aa7.4□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 PSMB2P49721 201 aa7.4□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.4□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 M0R381 172 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 GAS8-AS1O95177 125 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 HERVK_113P61574 105 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 ERCC8Q13216 396 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF815PA8K554 130 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 PPP1R17O96001 155 aa7.38□□□□□ -1.23
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APOBEC3G-201ENST00000407997 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLURP1P55000 103 aa7.38□□□□□ -1.23
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APOBEC3G-201ENST00000407997 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 Q8TAT8 98 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 RAX2Q96IS3 184 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 RHODO00212 210 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 MED14OSP0DP75 135 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 RNF182Q8N6D2 247 aa7.37□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 TCL1BO95988 128 aa7.36□□□□□ -1.23
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APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM231CP0DMU5 169 aa7.36□□□□□ -1.23
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APOBEC3G-201ENST00000407997 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.36□□□□□ -1.23
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APOBEC3G-201ENST00000407997 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.36□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A0J9YY99 117 aa7.35□□□□□ -1.23
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APOBEC3G-201ENST00000407997 K7EIL1 84 aa7.35□□□□□ -1.23
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APOBEC3G-201ENST00000407997 GAGE7O76087 117 aa7.35□□□□□ -1.23
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APOBEC3G-201ENST00000407997 GAGE12IP0CL82 117 aa7.35□□□□□ -1.23
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APOBEC3G-201ENST00000407997 A8MTW9 85 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 KLLNB2CW77 178 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.34□□□□□ -1.23
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.34□□□□□ -1.24
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRAC2D3DTV9 90 aa7.34□□□□□ -1.24
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APOBEC3G-201ENST00000407997 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.34□□□□□ -1.24
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.34□□□□□ -1.24
APOBEC3G-201ENST00000407997 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.34□□□□□ -1.24
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.34□□□□□ -1.24
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.34□□□□□ -1.24
APOBEC3G-201ENST00000407997 RASL10AQ92737 203 aa7.34□□□□□ -1.24
APOBEC3G-201ENST00000407997 PTH2Q96A98 100 aa7.34□□□□□ -1.24
APOBEC3G-201ENST00000407997 C20orf173Q96LM9 149 aa7.34□□□□□ -1.24
APOBEC3G-201ENST00000407997 B9D2Q9BPU9 175 aa7.34□□□□□ -1.24
APOBEC3G-201ENST00000407997 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.34□□□□□ -1.24
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A0B4J2C4 111 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-201ENST00000407997 C11orf86A6NJI1 115 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGLV1-51P01701 117 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGHV3-30P01768 117 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-201ENST00000407997 KRTAP10-11P60412 298 aa7.33□□□□□ -1.24
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.33□□□□□ -1.24
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