RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 GNLYP22749 145 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 SLURP1P55000 103 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 DIRC1Q969H9 104 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 DKK4Q9UBT3 224 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.39□□□□□ -1.23
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HERC3-202ENST00000402738 BPY2O14599 106 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 IGHV4-59P01825 116 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 CXCL5P42830 114 aa7.38□□□□□ -1.23
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HERC3-202ENST00000402738 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.38□□□□□ -1.23
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HERC3-202ENST00000402738 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.37□□□□□ -1.23
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HERC3-202ENST00000402738 CDIP1Q9H305 208 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 C20orf173Q96LM9 149 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 LINC00574Q9H8X3 128 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.36□□□□□ -1.23
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HERC3-202ENST00000402738 ESM1Q9NQ30 184 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 M0QY20 66 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 SPAG11BQ08648 103 aa7.35□□□□□ -1.23
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HERC3-202ENST00000402738 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 C16orf74Q96GX8 76 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 A0A087WVE0 104 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 K7EMT4 169 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 COX7BP24311 80 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 A0A087WW49 117 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-202ENST00000402738 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.34□□□□□ -1.23
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HERC3-202ENST00000402738 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
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HERC3-202ENST00000402738 WISP2O76076 250 aa7.34□□□□□ -1.23
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HERC3-202ENST00000402738 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.33□□□□□ -1.24
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HERC3-202ENST00000402738 ZMAT4Q9H898 229 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 Q6JHZ5 121 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa7.32□□□□□ -1.24
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HERC3-202ENST00000402738 PRR4Q16378 134 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZSV7 163 aa7.32□□□□□ -1.24
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HERC3-202ENST00000402738 TSHBP01222 138 aa7.31□□□□□ -1.24
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HERC3-202ENST00000402738 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.31□□□□□ -1.24
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HERC3-202ENST00000402738 APOC4P55056 127 aa7.31□□□□□ -1.24
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HERC3-202ENST00000402738 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 CCL24O00175 119 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 CNFNQ9BYD5 112 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 EP400Q96L91 3159 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZTI0 123 aa7.29□□□□□ -1.24
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