RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390935.1

RNA5SP18-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 18, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP18, Length 121 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP18-201ENST00000390935 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.04□□□□□ -1.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 GATD1Q8NB37 220 aa5.04□□□□□ -1.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.04□□□□□ -1.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 TMEM243Q9BU79 118 aa5.04□□□□□ -1.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.04□□□□□ -1.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 A0A1B0GUV1 79 aa5.03□□□□□ -1.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.03□□□□□ -1.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.03□□□□□ -1.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 CHAC1Q9BUX1 264 aa5.03□□□□□ -1.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RNA5SP18-201ENST00000390935 A8MWL6 223 aa5.02□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 UBE2L6O14933 153 aa5.02□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 AMTP48728 403 aa5.02□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 COTL1Q14019 142 aa5.02□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.02□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.02□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 ZNF727A8MUV8 499 aa5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 GAS8-AS1O95177 125 aa5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 LINC01551Q86U37 167 aa5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 FAM210AQ96ND0 272 aa5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 SDHAF1A6NFY7 115 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 HIGD1CA8MV81 97 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 CT83Q5H943 113 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 TEX261Q6UWH6 196 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 C9orf163Q8N9P6 203 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 CLRN3Q8NCR9 226 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 TSKUQ8WUA8 353 aa5□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 A0A1B0GUT8 65 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 hDV102S1A0JD36 115 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 FAM231BA6NCW3 169 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 PANO1I0J062 215 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 SLPIP03973 132 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 BORCS7Q96B45 105 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 OSTCQ9NRP0 149 aa4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.98□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.98□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.98□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 C9JQL5 133 aa4.98□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 I3L3M4 83 aa4.98□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 NCR2O95944 276 aa4.98□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 APCSP02743 223 aa4.98□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 FGF6P10767 208 aa4.98□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 RAB4AP20338 218 aa4.98□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 PMCHP20382 165 aa4.98□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 TMEM241Q24JQ0 296 aa4.98□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa4.98□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 NUP35Q8NFH5 326 aa4.98□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 RNF185Q96GF1 192 aa4.98□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 TMEM191AQ9H0A3 160 aa4.98□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 ST20Q9HBF5 79 aa4.98□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 V9GYV3 84 aa4.98□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 SMKR1H3BMG3 65 aa4.97□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 H7C423 109 aa4.97□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 J3QL48 77 aa4.97□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 TSHBP01222 138 aa4.97□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 RPL23P62829 140 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 AMN1Q8IY45 258 aa4.97□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 C15orf56Q8N910 161 aa4.97□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 ISOC2Q96AB3 205 aa4.97□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 AP5S1Q9NUS5 200 aa4.97□□□□□ -1.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 ESDP10768 282 aa4.96□□□□□ -1.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 RIGQ13278 110 aa4.96□□□□□ -1.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 ADIRFQ15847 76 aa4.96□□□□□ -1.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 FAM74A3Q4VXF1 159 aa4.96□□□□□ -1.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 DPH3Q96FX2 82 aa4.96□□□□□ -1.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 MRAP2Q96G30 205 aa4.96□□□□□ -1.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 TMEM242Q9NWH2 141 aa4.96□□□□□ -1.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 CHTF8P0CG12 524 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 CFAP161Q6P656 301 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 TMEM101Q96IK0 257 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 BTF3L4Q96K17 158 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 NAT8Q9UHE5 227 aa4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms