RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 LINC01546A6NGU7 62 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 LINC01549A6NIU2 74 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 UBE2L6O14933 153 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 NUPR1O60356 82 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 TSHBP01222 138 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 PMCHL1Q16048 86 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRK-201ENST00000368202 LINC00310P59036 64 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 NUPR2A6NF83 97 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 LEPROTL1O95214 131 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00694P0DN24 101 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.49□□□□□ -1.05
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PTPRK-201ENST00000368202 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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PTPRK-201ENST00000368202 FABP4P15090 132 aa8.48□□□□□ -1.05
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PTPRK-201ENST00000368202 ATP5LO75964 103 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 TOMM6Q96B49 74 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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PTPRK-201ENST00000368202 TGP01266 2768 aa8.47□□□□□ -1.05
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PTPRK-201ENST00000368202 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-201ENST00000368202 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-201ENST00000368202 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-201ENST00000368202 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-201ENST00000368202 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-201ENST00000368202 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-201ENST00000368202 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRK-201ENST00000368202 H7C423 109 aa8.45□□□□□ -1.06
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PTPRK-201ENST00000368202 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.45□□□□□ -1.06
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PTPRK-201ENST00000368202 KRTDAPP60985 99 aa8.43□□□□□ -1.06
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PTPRK-201ENST00000368202 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRK-201ENST00000368202 TIMM17AQ99595 171 aa8.42□□□□□ -1.06
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PTPRK-201ENST00000368202 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRK-201ENST00000368202 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.41□□□□□ -1.06
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PTPRK-201ENST00000368202 NPSP0C0P6 89 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRK-201ENST00000368202 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRK-201ENST00000368202 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRK-201ENST00000368202 VCX2Q9H322 139 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRK-201ENST00000368202 IGIPA6NJ69 53 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 C3orf79P0CE67 100 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 APLNQ9ULZ1 77 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 PMVKQ15126 192 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRK-201ENST00000368202 PET117Q6UWS5 81 aa8.38□□□□□ -1.07
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