RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 K7ERJ3 54 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 CRYGAP11844 174 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGKV3-20P01619 116 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGLV2-8P01709 118 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 SHISA2Q6UWI4 295 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 TPSG1Q9NRR2 321 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 FAM30AQ9NZY2 134 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa3.73□□□□□ -1.81
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PTPRD-201ENST00000355233 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 SPINK13Q1W4C9 94 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 C10orf55Q5SWW7 151 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 ODF3L1Q8IXM7 274 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 FXYD7P58549 80 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 DEFB114Q30KQ6 69 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 C2orf91Q6ZV80 131 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 U3KQE9 123 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 MIFP14174 115 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 C1orf195Q5TG92 126 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 SORL1Q92673 2214 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa3.71□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 PRB1P04280 392 aa3.71□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 DEFB112Q30KQ8 113 aa3.71□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.71□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa3.71□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa3.71□□□□□ -1.81
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PTPRD-201ENST00000355233 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.81
PTPRD-201ENST00000355233 KLLNB2CW77 178 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 M0R378 163 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 HHLA3Q9XRX5 114 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 Q8N9W7 124 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 RS1O15537 224 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 CD24P25063 80 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 PATE2Q6UY27 113 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF843Q8N446 348 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 Q8NA96 180 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.71□□□□□ -1.82
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PTPRD-201ENST00000355233 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa3.7□□□□□ -1.82
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PTPRD-201ENST00000355233 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.7□□□□□ -1.82
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PTPRD-201ENST00000355233 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 F5H768 121 aa3.7□□□□□ -1.82
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PTPRD-201ENST00000355233 M0QY20 66 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 LY6HO94772 140 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV4-59P01825 116 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRD-201ENST00000355233 A0A1B0GUV1 79 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 TRIAP1O43715 76 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 C20orf197Q8N268 126 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 ZNRD1Q9P1U0 126 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRD-201ENST00000355233 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 C10orf142B7Z368 130 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRD-201ENST00000355233 SIRPDQ9H106 197 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 A6NDX4 124 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 GRNP28799 593 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 SBSPONQ8IVN8 264 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 C2orf48Q96LS8 159 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 MT-ATP8P03928 68 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 GYPEP15421 78 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 CASC2Q6XLA1 102 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRD-201ENST00000355233 APRG1Q8IVJ8 170 aa3.68□□□□□ -1.82
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