RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
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TSNARE1-201ENST00000307180 FAM74A4Q5TZK3 123 aa11.54□□□□□ -0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 GTSCR1Q86UQ5 136 aa11.54□□□□□ -0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 MRAPQ8TCY5 172 aa11.54□□□□□ -0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
TSNARE1-201ENST00000307180 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
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TSNARE1-201ENST00000307180 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa11.52□□□□□ -0.56
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TSNARE1-201ENST00000307180 KIR2DL4Q99706 377 aa11.5□□□□□ -0.57
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TSNARE1-201ENST00000307180 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa11.5□□□□□ -0.57
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TSNARE1-201ENST00000307180 CYSLTR1Q9Y271 337 aa11.5□□□□□ -0.57
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TSNARE1-201ENST00000307180 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa11.48□□□□□ -0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 TTTY13Q9BZ97 58 aa11.48□□□□□ -0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 HIGD1BQ9P298 99 aa11.48□□□□□ -0.57
TSNARE1-201ENST00000307180 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa11.48□□□□□ -0.57
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TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM141Q96I45 108 aa11.45□□□□□ -0.58
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TSNARE1-201ENST00000307180 ERG28Q9UKR5 140 aa11.43□□□□□ -0.58
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa11.42□□□□□ -0.58
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TSNARE1-201ENST00000307180 C11orf72Q8NBR9 251 aa11.41□□□□□ -0.58
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TSNARE1-201ENST00000307180 XCL2Q9UBD3 114 aa11.41□□□□□ -0.58
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TSNARE1-201ENST00000307180 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.41□□□□□ -0.58
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TSNARE1-201ENST00000307180 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa11.4□□□□□ -0.58
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TSNARE1-201ENST00000307180 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa11.38□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 C11orf86A6NJI1 115 aa11.38□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 A8MZ25 164 aa11.38□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 Q6ZSN1 163 aa11.38□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 SBSPONQ8IVN8 264 aa11.38□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.38□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa11.38□□□□□ -0.59
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