RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000235347.4

PRAMEF10-201, Transcript of PRAME family member 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF10, Length 1,525 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10-201ENST00000235347 MGPP08493 103 aa6.5□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.5□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 SEC11AP67812 179 aa6.5□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF415Q09FC8 603 aa6.5□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 PCP2Q8IVA1 136 aa6.5□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 NACAE9PAV3 2078 aa6.49□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.49□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.49□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 LYRM9A8MSI8 78 aa6.49□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 HSD52Q0P140 79 aa6.49□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 C12orf74Q32Q52 190 aa6.49□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.49□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.49□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 Q6ZTC4 211 aa6.49□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 JPT2Q9H910 190 aa6.49□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 MDFICQ9P1T7 246 aa6.49□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 HIGD1BQ9P298 99 aa6.49□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 DAD1P61803 113 aa6.48□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.48□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 LINC01549A6NIU2 74 aa6.47□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 F8VRH5 84 aa6.47□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 H7C1H1 209 aa6.47□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 DEFB130BP0DP73 79 aa6.47□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 DEFB130AP0DP74 79 aa6.47□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 PLNP26678 52 aa6.47□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 NMUP48645 174 aa6.47□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 UBE2V1Q13404 147 aa6.47□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.47□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.47□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 Q6ZTI0 123 aa6.47□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.47□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 SYT8Q8NBV8 401 aa6.47□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.47□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.46□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 GAGE12BA1L429 117 aa6.46□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 C3orf84H3BNL1 204 aa6.46□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 CCL25O15444 150 aa6.46□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 GAGE7O76087 117 aa6.46□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 CRYGDP07320 174 aa6.46□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 GAGE12FP0CL80 117 aa6.46□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 GAGE12GP0CL81 117 aa6.46□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 GAGE12IP0CL82 117 aa6.46□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 TCTAP57738 103 aa6.46□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 ERASQ7Z444 233 aa6.46□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 BAALCQ8WXS3 180 aa6.46□□□□□ -1.37
PRAMEF10-201ENST00000235347 A0A087WWL8 130 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 NUPR2A6NF83 97 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 M0QY20 66 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 VCYO14598 125 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 CASC10Q5T4H9 136 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 SPXQ9BT56 116 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 IGIPA6NJ69 53 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 TSHBP01222 138 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 HTN3P15516 51 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.44□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.44□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 A6NDN8 102 aa6.44□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.44□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 H3BRM9 83 aa6.44□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 M0R2P5 195 aa6.44□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 PTTG1IPP53801 180 aa6.44□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.44□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 PTH2Q96A98 100 aa6.44□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 TIMM17AQ99595 171 aa6.44□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.44□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.43□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 F5H697 171 aa6.43□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 ATP5G1P05496 136 aa6.43□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 RHOHQ15669 191 aa6.43□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF876PQ49A33 203 aa6.43□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.43□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMEM141Q96I45 108 aa6.43□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 KIR2DL4Q99706 377 aa6.43□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.42□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.42□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 E9PLD3 99 aa6.42□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 VAMP3Q15836 100 aa6.42□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF56Q15929 161 aa6.42□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 TAL2Q16559 108 aa6.42□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.42□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.42□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 TM2D2Q9BX73 214 aa6.42□□□□□ -1.38
PRAMEF10-201ENST00000235347 C9orf118A6NHY6 69 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms