RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF479Q96JC4 524 aa6.81□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.81□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 X6R8D5 127 aa6.81□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.81□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.8□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 hDV102S1A0JD36 115 aa6.8□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 A8MZ25 164 aa6.8□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 DPM2O94777 84 aa6.8□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 NPSP0C0P6 89 aa6.8□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 P0DMU3 169 aa6.8□□□□□ -1.32
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APOBEC1-201ENST00000229304 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.79□□□□□ -1.32
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APOBEC1-201ENST00000229304 K7EQD1 137 aa6.79□□□□□ -1.32
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APOBEC1-201ENST00000229304 IGKCP01834 107 aa6.79□□□□□ -1.32
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APOBEC1-201ENST00000229304 BAALCQ8WXS3 180 aa6.79□□□□□ -1.32
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APOBEC1-201ENST00000229304 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.79□□□□□ -1.32
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APOBEC1-201ENST00000229304 H3BS24 57 aa6.78□□□□□ -1.32
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APOBEC1-201ENST00000229304 CRYBA4P53673 196 aa6.78□□□□□ -1.32
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APOBEC1-201ENST00000229304 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
APOBEC1-201ENST00000229304 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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APOBEC1-201ENST00000229304 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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APOBEC1-201ENST00000229304 MIFP14174 115 aa6.77□□□□□ -1.33
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APOBEC1-201ENST00000229304 PMVKQ15126 192 aa6.77□□□□□ -1.33
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APOBEC1-201ENST00000229304 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.75□□□□□ -1.33
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APOBEC1-201ENST00000229304 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.74□□□□□ -1.33
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APOBEC1-201ENST00000229304 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.73□□□□□ -1.33
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APOBEC1-201ENST00000229304 SIVA1O15304 175 aa6.73□□□□□ -1.33
APOBEC1-201ENST00000229304 CTAG1AP78358 180 aa6.73□□□□□ -1.33
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APOBEC1-201ENST00000229304 GAGE1Q13065 139 aa6.73□□□□□ -1.33
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APOBEC1-201ENST00000229304 GAGE5Q13069 117 aa6.73□□□□□ -1.33
APOBEC1-201ENST00000229304 GAGE13Q4V321 117 aa6.73□□□□□ -1.33
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.73□□□□□ -1.33
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.73□□□□□ -1.33
APOBEC1-201ENST00000229304 NFE4Q86UQ8 179 aa6.73□□□□□ -1.33
APOBEC1-201ENST00000229304 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.73□□□□□ -1.33
APOBEC1-201ENST00000229304 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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