RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 IGKV3-20P01619 116 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 SLURP1P55000 103 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF415Q09FC8 603 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 A8MWV9 139 aa6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 SPRY2O43597 315 aa6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 AMTNQ6UX39 209 aa6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 PTH2Q96A98 100 aa6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 HIST1H4GQ99525 98 aa6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 FLNCQ14315 2725 aa6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRK2Q5S007 2527 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 IGIPA6NJ69 53 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 C11orf86A6NJI1 115 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 I3L3M4 83 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 M0QY20 66 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 RHODO00212 210 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 INSP01308 110 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 DEFB131AP59861 70 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF876PQ49A33 203 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 DUX3Q96PT4 197 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 MDFICQ9P1T7 246 aa6.79□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF815PA8K554 130 aa6.78□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 H3BMM0 161 aa6.78□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 K7ERU9 68 aa6.78□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 M0R2P5 195 aa6.78□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 CRYGDP07320 174 aa6.78□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 FXYD2P54710 66 aa6.78□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.78□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.78□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.78□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB37Q96AX2 223 aa6.78□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 CST9LQ9H4G1 147 aa6.78□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 TENM4Q6N022 2769 aa6.78□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 GAGE12BA1L429 117 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 KNCNA6PVL3 124 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP10-9P60411 292 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 SPATA25Q9BR10 227 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 SPXQ9BT56 116 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 JPT2Q9H910 190 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 PTPN13Q12923 2485 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 RELNP78509 3460 aa6.77□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 TSHBP01222 138 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 CRYBA4P53673 196 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 DEFB136Q30KP8 78 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 NFE4Q86UQ8 179 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.76□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 GYPEP15421 78 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF479Q96JC4 524 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.75□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 CR1P17927 2039 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1B0GWB2 263 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 K7ERJ3 54 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 C12orf74Q32Q52 190 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6ZSV7 163 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC01587Q99440 93 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 VCX2Q9H322 139 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.74□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.73□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLL5B9A064 214 aa6.73□□□□□ -1.33
EFTUD2-222ENST00000592408 LEPROTO15243 131 aa6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 150.7 ms