RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBCD-223	ENST00000576691	SCO1	O75880	301 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBCD-223	ENST00000576691	APCS	P02743	223 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBCD-223	ENST00000576691	CKS2	P33552	79 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBCD-223	ENST00000576691	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TBCD-223	ENST00000576691	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TBCD-223	ENST00000576691	COLCA2	A8K830	154 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBCD-223	ENST00000576691	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBCD-223	ENST00000576691	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TBCD-223	ENST00000576691	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TBCD-223	ENST00000576691	PHOX2A	O14813	284 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ORMDL3	Q8N138	153 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TBCD-223	ENST00000576691	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TBCD-223	ENST00000576691	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TBCD-223	ENST00000576691	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TBCD-223	ENST00000576691		A0A096LPF7	62 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691		P0DMU3	169 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	FAM231A	P0DMU4	169 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	FAM231C	P0DMU5	169 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	SRI	P30626	198 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	GAGE12J	A6NER3	117 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691		D6R8Y8	96 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	NUDT3	O95989	172 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	LINC00694	P0DN24	101 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	GAGE1	Q13065	139 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	GAGE4	Q13068	117 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	GAGE5	Q13069	117 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	GAGE13	Q4V321	117 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	C20orf78	Q9BR46	151 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691		Q9UF83	564 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	APLN	Q9ULZ1	77 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	RAB5A	P20339	215 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	UBE2D3	P61077	147 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	UBE2D2	P62837	147 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	CASC10	Q5T4H9	136 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	NRAC	Q8N912	160 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	PRELID3A	Q96N28	172 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	ST20	Q9HBF5	79 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	TENM2	Q9NT68	2774 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	TIRAP	P58753	221 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	SMKR1	H3BMG3	65 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	GAS8-AS1	O95177	125 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	TNFRSF6B	O95407	300 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	NCR2	O95944	276 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	PRSS47	A8MTI9	375 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TBCD-223	ENST00000576691	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	VCY	O14598	125 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	NPY	P01303	97 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	CCL18	P55774	89 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	LYST	Q99698	3801 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691		I3L3M4	83 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	TCAP	O15273	167 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	TRGC2	P03986	189 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	PMCH	P20382	165 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	ESRG	Q1W209	222 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	COTL1	Q14019	142 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	KIR2DL4	Q99706	377 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	LELP1	Q5T871	98 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TBCD-223	ENST00000576691	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TBCD-223	ENST00000576691	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TBCD-223	ENST00000576691	LCE6A	A0A183	80 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TBCD-223	ENST00000576691		K7EMI3	77 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TBCD-223	ENST00000576691		Q8N8P6	123 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TBCD-223	ENST00000576691	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		11.57	□□□□□ -0.56
TBCD-223	ENST00000576691	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
TBCD-223	ENST00000576691	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		11.56	□□□□□ -0.56
TBCD-223	ENST00000576691	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		11.56	□□□□□ -0.56
TBCD-223	ENST00000576691	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		11.56	□□□□□ -0.56

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms