RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		7.4	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	CRYGD	P07320	174 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	CCL25	O15444	150 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	NUDT3	O95989	172 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	CSTL1	Q9H114	145 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	DKK2	Q9UBU2	259 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279		F5H697	171 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279		K7EMI3	77 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	ATP5L	O75964	103 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	IGLV1-51	P01701	117 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	PRM2	P04554	102 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	HTN1	P15515	57 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	PTTG1IP	P53801	180 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	ODF1	Q14990	250 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF876P	Q49A33	203 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	OR11H12	B2RN74	326 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	INS	P01308	110 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	PRSS1	P07477	247 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	UBE2V1	Q13404	147 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	TOMM6	Q96B49	74 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	ZMAT4	Q9H898	229 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	NACA	E9PAV3	2078 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	NOTCH1	P46531	2555 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279		M0QY20	66 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF56	Q15929	161 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	STH	Q8IWL8	128 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	STPG4	Q8N801	248 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	LINC01587	Q99440	93 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM238	C9JI98	176 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF415	Q09FC8	603 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	XCL2	Q9UBD3	114 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279		M0R2P5	195 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	WIPF1	O43516	503 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	COX8A	P10176	69 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	BATF	Q16520	125 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	VCY	O14598	125 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	INSL3	P51460	131 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	PTH2	Q96A98	100 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279		A0A087WX48	190 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	FGF6	P10767	208 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TCF4-231	ENST00000566279	IGKC	P01834	107 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	FBN3	Q75N90	2809 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279		A8MWV9	139 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	DPM2	O94777	84 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	TCTA	P57738	103 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	KIR2DL4	Q99706	377 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279		K7EIL1	84 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	AZU1	P20160	251 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	SPX	Q9BT56	116 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	RNF151	Q2KHN1	245 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	ERAS	Q7Z444	233 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	BAALC	Q8WXS3	180 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TCF4-231	ENST00000566279	COX11	Q9Y6N1	276 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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