RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPART-AS1P0CW21 52 aa12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 P0DMU3 169 aa12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM231AP0DMU4 169 aa12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM231CP0DMU5 169 aa12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 DAD1P61803 113 aa12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 C20orf78Q9BR46 151 aa12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 NIT2Q9NQR4 276 aa12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 CIDEAO60543 219 aa12.24□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 PMCHP20382 165 aa12.24□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 LINC00612Q8N6U2 182 aa12.24□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 AP5S1Q9NUS5 200 aa12.24□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 CELA1Q9UNI1 258 aa12.24□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM19A2Q8N3H0 131 aa12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRSS47A8MTI9 375 aa12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 ESDP10768 282 aa12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 FABP4P15090 132 aa12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 Q8N8P6 123 aa12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMIM2Q9BVW6 85 aa12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 AMTP48728 403 aa12.22□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM18Q96B42 140 aa12.22□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 C18orf15Q96N68 181 aa12.22□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 EDA2RQ9HAV5 297 aa12.22□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 SDHAF1A6NFY7 115 aa12.21□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 PMCHL1Q16048 86 aa12.21□□□□□ -0.45
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa12.2□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 K7EQD1 137 aa12.2□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 FHL2Q14192 279 aa12.2□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC25A29Q8N8R3 303 aa12.2□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM70Q9BUB7 260 aa12.2□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa12.2□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A0J9YWU9 116 aa12.2□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 IFITM10A6NMD0 228 aa12.2□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TCAPO15273 167 aa12.2□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 NEGR1Q7Z3B1 354 aa12.2□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa12.2□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 HIST1H2BLQ99880 126 aa12.2□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 Q9UF83 564 aa12.2□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 VCYO14598 125 aa12.19□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 AKR1D1P51857 326 aa12.19□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa12.19□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNAJC30Q96LL9 226 aa12.19□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa12.18□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa12.18□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATP5G1P05496 136 aa12.18□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNRF2Q8NHG8 242 aa12.18□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIR2DL4Q99706 377 aa12.18□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 HHLA3Q9XRX5 114 aa12.18□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa12.17□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 HTN3P15516 51 aa12.17□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPL32P62910 135 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 LAGE3Q14657 143 aa12.17□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRADC1Q9BSG0 188 aa12.17□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TENM3Q9P273 2699 aa12.16□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa12.16□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 RHOHQ15669 191 aa12.16□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR10D4PQ8NGN7 298 aa12.16□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa12.15□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa12.15□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 GAGE12JA6NER3 117 aa12.15□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 LINC01546A6NGU7 62 aa12.15□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 I3L3M4 83 aa12.15□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 FCER1GP30273 86 aa12.15□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 GAGE1Q13065 139 aa12.15□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 GAGE4Q13068 117 aa12.15□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 GAGE5Q13069 117 aa12.15□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 GAGE13Q4V321 117 aa12.15□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 F5H768 121 aa12.15□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 C12orf74Q32Q52 190 aa12.15□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ORMDL2Q53FV1 153 aa12.15□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRO0255Q9UI72 69 aa12.15□□□□□ -0.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa12.14□□□□□ -0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa12.14□□□□□ -0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUDT3O95989 172 aa12.14□□□□□ -0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 BTF3P20290 206 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 K7EMI3 77 aa12.13□□□□□ -0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 LEPROTL1O95214 131 aa12.13□□□□□ -0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 HBDP02042 147 aa12.13□□□□□ -0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 CRYBA4P53673 196 aa12.13□□□□□ -0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 C11orf45Q8TAV5 145 aa12.13□□□□□ -0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 PAX4O43316 350 aa12.12□□□□□ -0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A096LNJ9 63 aa12.11□□□□□ -0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A0J9YY99 117 aa12.11□□□□□ -0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 TSHBP01222 138 aa12.1□□□□□ -0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 GYPEP15421 78 aa12.1□□□□□ -0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBE2D3P61077 147 aa12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.3 ms