RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 FHL3Q13643 280 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRB-209ENST00000550857 Q8N2B8 174 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRB-209ENST00000550857 LINC00467Q9BRT7 94 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRB-209ENST00000550857 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRB-209ENST00000550857 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRB-209ENST00000550857 H3BNG1 76 aa5.96□□□□□ -1.45
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