RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 TSPAN13O95857 204 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 AMTP48728 403 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 ZNF56Q15929 161 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 ZFP82Q8N141 532 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 EPDR1Q9UM22 224 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 K7EQM0 130 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 H3BMQ9 156 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 TMBIM6P55061 237 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 CARD19Q96LW7 228 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 H0YIZ8 118 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 SH2D1AO60880 128 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 SULT1A2P50226 295 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 FOXI1Q12951 378 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CS-208ENST00000547298 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 UBE2D1P51668 147 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 GAGE2BQ13066 116 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 LINC01559Q495D7 138 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 TMEM243Q9BU79 118 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 Q86TA4 180 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 A0A1W2PPV4 95 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 STAG3L2P0CL84 134 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 STAG3L3P0CL85 134 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 F5H697 171 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 M0QY20 66 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 GCHFRP30047 84 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 SYCNQ0VAF6 134 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 TPRXLQ17RH7 258 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 CDIP1Q9H305 208 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 BCL2P10415 239 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 WFDC1Q9HC57 220 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 SNAI2O43623 268 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-208ENST00000547298 A0A087WZ39 114 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 PLA2G10O15496 165 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 DEFA3P59666 94 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 LCE2CQ5TA81 110 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 TRIQKQ629K1 86 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 RAB24Q969Q5 203 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 MED28Q9H204 178 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 HSPB11Q9Y547 144 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 PEX7O00628 323 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 SIX6O95475 246 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 FGF6P10767 208 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 NUP35Q8NFH5 326 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 A0A087X002 238 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 A0A1W2PRE2 83 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 CENPXA8MT69 81 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 UBE2L6O14933 153 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 XCL1P47992 114 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 FAM168BA1KXE4 195 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-208ENST00000547298 OR5AL1P0C617 328 aa6.55□□□□□ -1.36
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