RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.79□□□□□ -1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.79□□□□□ -1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 STAB1Q9NY15 2570 aa8.78□□□□□ -1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.78□□□□□ -1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC01546A6NGU7 62 aa8.78□□□□□ -1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 I3L3M4 83 aa8.78□□□□□ -1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SCGB1D1O95968 90 aa8.78□□□□□ -1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRTDAPP60985 99 aa8.78□□□□□ -1
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.78□□□□□ -1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.77□□□□□ -1.01
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATP5LO75964 103 aa8.77□□□□□ -1.01
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DEFB130BP0DP73 79 aa8.77□□□□□ -1.01
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DEFB130AP0DP74 79 aa8.77□□□□□ -1.01
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 S100A12P80511 92 aa8.77□□□□□ -1.01
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.77□□□□□ -1.01
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C18orf15Q96N68 181 aa8.77□□□□□ -1.01
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.76□□□□□ -1.01
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IFITM10A6NMD0 228 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXC-AS2-201ENST00000513533 K7EQD1 137 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RHOHQ15669 191 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.76□□□□□ -1.01
HOXC-AS2-201ENST00000513533 VWFP04275 2813 aa8.75□□□□□ -1.01
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 GAS8-AS1O95177 125 aa8.75□□□□□ -1.01
HOXC-AS2-201ENST00000513533 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
HOXC-AS2-201ENST00000513533 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PMCHL1Q16048 86 aa8.75□□□□□ -1.01
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.75□□□□□ -1.01
HOXC-AS2-201ENST00000513533 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.75□□□□□ -1.01
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPATA25Q9BR10 227 aa8.75□□□□□ -1.01
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.74□□□□□ -1.01
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COTL1Q14019 142 aa8.74□□□□□ -1.01
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF479Q96JC4 524 aa8.74□□□□□ -1.01
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.74□□□□□ -1.01
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.72□□□□□ -1.01
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 C3orf79P0CE67 100 aa8.71□□□□□ -1.02
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.71□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.7□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.7□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.7□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.7□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TOMM6Q96B49 74 aa8.7□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM141Q96I45 108 aa8.7□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NACAE9PAV3 2078 aa8.69□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DEFB4AO15263 64 aa8.69□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PAX4O43316 350 aa8.69□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FHL2Q14192 279 aa8.69□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PYY3Q5JQD4 70 aa8.69□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q6ZSN1 163 aa8.69□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ERASQ7Z444 233 aa8.69□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.69□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GAGE12JA6NER3 117 aa8.68□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 F5H768 121 aa8.68□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 H0Y8G0 127 aa8.68□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 K7EIL1 84 aa8.68□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 P0DMU3 169 aa8.68□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM231AP0DMU4 169 aa8.68□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM231CP0DMU5 169 aa8.68□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GAGE1Q13065 139 aa8.68□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GAGE4Q13068 117 aa8.68□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GAGE5Q13069 117 aa8.68□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GAGE13Q4V321 117 aa8.68□□□□□ -1.02
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.68□□□□□ -1.02
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