RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TCAPO15273 167 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R17O96001 155 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 SMIM17P0DL12 118 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
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PTPRC-210ENST00000462363 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00482Q8N8I6 264 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 C11orf44Q8N8P7 122 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 DYNLRB2Q8TF09 96 aa4.1□□□□□ -1.75
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PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZN92 141 aa4.08□□□□□ -1.76
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PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZSN1 163 aa4.07□□□□□ -1.76
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PTPRC-210ENST00000462363 F8VRH5 84 aa4.05□□□□□ -1.76
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PTPRC-210ENST00000462363 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-210ENST00000462363 RHODO00212 210 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-210ENST00000462363 SIVA1O15304 175 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-210ENST00000462363 IGKCP01834 107 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-210ENST00000462363 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-210ENST00000462363 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-210ENST00000462363 PCP2Q8IVA1 136 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-210ENST00000462363 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-210ENST00000462363 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.05□□□□□ -1.76
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