RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 RAB5AP20339 215 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF56Q15929 161 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP4-207ENST00000454947 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A0J9YY99 117 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 H7C1H1 209 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 MGPP08493 103 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 P0DMU3 169 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM231AP0DMU4 169 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM231CP0DMU5 169 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 LYSTQ99698 3801 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 PRSS47A8MTI9 375 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 D6R8Y8 96 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 NCR2O95944 276 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 APCSP02743 223 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 UBE2D3P61077 147 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 UBE2D2P62837 147 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 ORMDL3Q8N138 153 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 APLNQ9ULZ1 77 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 TENM2Q9NT68 2774 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A096LPF7 62 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 F5H697 171 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 SMKR1H3BMG3 65 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 LY6G6CO95867 125 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 PPP1R17O96001 155 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 GYPEP15421 78 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 SRIP30626 198 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 CCL18P55774 89 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 TIRAPP58753 221 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 C20orf78Q9BR46 151 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 NIT2Q9NQR4 276 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 TNFRSF6BO95407 300 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 NPYP01303 97 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 CKS2P33552 79 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 PRELID3AQ96N28 172 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 LCE6AA0A183 80 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 GAGE12JA6NER3 117 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC01546A6NGU7 62 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 TRGC2P03986 189 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 GAGE1Q13065 139 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 GAGE4Q13068 117 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 GAGE5Q13069 117 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 GAGE13Q4V321 117 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-207ENST00000454947 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 ST20Q9HBF5 79 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 TSHBP01222 138 aa6.45□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.45□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.45□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.45□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.45□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.45□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 I3L3M4 83 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 K7EMI3 77 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 VCYO14598 125 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 HIST1H2BKO60814 126 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 HIST1H2BJP06899 126 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 ESDP10768 282 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 HIST1H2BOP23527 126 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 HIST1H2BBP33778 126 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 HIST1H2BDP58876 126 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC00310P59036 64 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 HIST1H2BCP62807 126 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 Q0VG73 95 aa6.44□□□□□ -1.38
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