RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453727.6

LMO3-210, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5

Gene LMO3, Length 2,403 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-210ENST00000453727 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
LMO3-210ENST00000453727 TMEM213A2RRL7 107 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 SMKR1H3BMG3 65 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 PLNP26678 52 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 EMP1P54849 157 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 H3BTX0 84 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.46□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 MAST4O15021 2626 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 TMEM89A2RUT3 159 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 NDUFA7O95182 113 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 UBE2D1P51668 147 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 OTORQ9NRC9 128 aa6.45□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 Q8N1Y9 231 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 C17orf77Q96MU5 243 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 ODF3Q96PU9 254 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 SPANXCQ9NY87 97 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 ELANEP08246 267 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 JMJD1CQ15652 2540 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.44□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 A0A1B0GX51 115 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 HERVK_113P63121 156 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 TMEM101Q96IK0 257 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.43□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 NDUFA4O00483 81 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 BUB3O43684 328 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 CD7P09564 240 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 ZNF56Q15929 161 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 RNF152Q8N8N0 203 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 LINC01006Q8NI28 216 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 LINC01546A6NGU7 62 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 ZNF815PA8K554 130 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 IGLV2-11P01706 119 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 METTL26Q96S19 204 aa6.42□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.42□□□□□ -1.38
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LMO3-210ENST00000453727 H7C1H1 209 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 M0R2P5 195 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 BAALCQ8WXS3 180 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 C16orf95Q9H693 158 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 U3KQE9 123 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 UQCRQO14949 82 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 TNFRSF6BO95407 300 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 IGLC6P0CF74 106 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 HLA-DMBP28068 263 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
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LMO3-210ENST00000453727 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.41□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.4□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 ZNF785A8K8V0 405 aa6.4□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 F8VRH5 84 aa6.4□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.4□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.4□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.4□□□□□ -1.38
LMO3-210ENST00000453727 H3BMM0 161 aa6.4□□□□□ -1.39
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LMO3-210ENST00000453727 CRIP1P50238 77 aa6.4□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 PDE6HQ13956 83 aa6.4□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.4□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.4□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 UBE2WQ96B02 151 aa6.4□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 ASCL2Q99929 193 aa6.4□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 A0A087WW49 117 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 LGALS9O00182 355 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 GPHB5Q86YW7 130 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.39□□□□□ -1.39
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