RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384121.1

RNU6-890P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 890, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-890P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-890P-201ENST00000384121 COX6B1P14854 86 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 CFAP126Q5VTH2 177 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 SNX29P2Q8IUI4 249 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 LAMC1P11047 1609 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 FAM107AO95990 144 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 SMIM6P0DI80 62 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 PSPHP78330 225 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 PIGYQ3MUY2 71 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 BAGE3Q86Y29 109 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 CASZ1Q86V15 1759 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 TCRAP04437 139 aa-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 TMED4Q7Z7H5 227 aa-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 J3KT08 172 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 FAM92AA1XBS5 289 aa-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 PFDN1O60925 122 aa-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 PI4KAP42356 2102 aa-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-890P-201ENST00000384121 WDR7Q9Y4E6 1490 aa-2.22□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 NRXN2Q9P2S2 1712 aa-2.22□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 MED23Q9ULK4 1368 aa-2.23□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 ERCC6L2Q5T890 1561 aa-2.23□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-2.23□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 STX12Q86Y82 276 aa-2.23□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 THEM6Q8WUY1 208 aa-2.23□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa-2.23□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 WNK3Q9BYP7 1800 aa-2.24□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 BIRC6Q9NR09 4857 aa-2.24□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 SERPINB1P30740 379 aa-2.24□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-2.24□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 TMEM91Q6ZNR0 172 aa-2.24□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa-2.24□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 SDF2Q99470 211 aa-2.24□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-2.24□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-2.24□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 ITPR3Q14573 2671 aa-2.24□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 MYH3P11055 1940 aa-2.25□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 PLXNB2O15031 1838 aa-2.25□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 H0YJX3 145 aa-2.25□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa-2.25□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 LRP6O75581 1613 aa-2.25□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 KDM3BQ7LBC6 1761 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 TSC2P49815 1807 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 BICRAQ9NZM4 1560 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 E7EQ34 232 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 J3QLW9 94 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 RBP4P02753 201 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 TMEM78Q5T7P6 136 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 BOLA2Q9H3K6 86 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 A0A1W2PRE2 83 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 CLPSL1A2RUU4 121 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 YPEL1O60688 119 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 IFT172Q9UG01 1749 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 CCDC115Q96NT0 180 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-890P-201ENST00000384121 PARP14Q460N5 1801 aa-2.28□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 NDUFA12Q9UI09 145 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 STOML2Q9UJZ1 356 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 SMIM24O75264 130 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 HLA-DRB4P13762 266 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 UBE2D1P51668 147 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 RPRMQ9NS64 109 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 CALML5Q9NZT1 146 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 RYR2Q92736 4967 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 TACC2O95359 2948 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 LINC01545Q5VT33 79 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 SMIM4Q8WVI0 70 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 SPG11Q96JI7 2443 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 DEFB135Q30KP9 77 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 CLLU1Q5K131 121 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 C10orf82Q8WW14 230 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 PAPPAQ13219 1627 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 TNFP01375 233 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 IFNA17P01571 189 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 PAEPP09466 180 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 DEFB105AQ8NG35 78 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 MUC17Q685J3 4493 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 SONP18583 2426 aaKnown RBP-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-890P-201ENST00000384121 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-2.35□□□□□ -2.79
RNU6-890P-201ENST00000384121 SYNMO15061 1565 aa-2.35□□□□□ -2.79
RNU6-890P-201ENST00000384121 A6NIN4 97 aa-2.35□□□□□ -2.79
RNU6-890P-201ENST00000384121 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-2.35□□□□□ -2.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms