RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373190.5

PTPRT-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-204ENST00000373190 J3QLI3 93 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 Q8N1Y9 231 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 RBX1P62877 108 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 Q6ZQT7 251 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 TEX22C9J3V5 150 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 CTSGP08311 255 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 Q6ZSR3 168 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 PROP1O75360 226 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 SPRY2O43597 315 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 PRSS33Q8NF86 280 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 CXCL5P42830 114 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 NDUFB1O75438 58 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 TM2D2Q9BX73 214 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 RNF223E7ERA6 249 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 CGB3P0DN86 165 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 GYPEP15421 78 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 RITA1Q96K30 269 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 CTSZQ9UBR2 303 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 TRBV12-3P01733 135 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 FAM236CP0DP71 79 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 U3KQA8 63 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 MDFICQ9P1T7 246 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF503Q96F45 646 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 Q9HAA7 133 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 IGLC6P0CF74 106 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 CGB7P0DN87 165 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 LTBP2Q14767 1821 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 A0A0J9YY99 117 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 NCR3O14931 201 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 DIRC1Q969H9 104 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 NFE4Q86UQ8 179 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 NDUFA7O95182 113 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV2-23P01705 113 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 NDUFA1O15239 70 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 V9GYY9 64 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 YPEL4Q96NS1 127 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 K7ENP7 123 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 P0DMU3 169 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 FAM231AP0DMU4 169 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 FAM231CP0DMU5 169 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 DKK4Q9UBT3 224 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 DEFB136Q30KP8 78 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 COL4A3Q01955 1670 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV2-8P01709 118 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 TIRAPP58753 221 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 A0A0J9YXY3 114 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 PRAC2D3DTV9 90 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 E7EUB6 86 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 C20orf197Q8N268 126 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 IMUPQ9GZP8 106 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 P0C879 139 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 CCL24O00175 119 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 SLURP1P55000 103 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-204ENST00000373190 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.74□□□□□ -1.33
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